Bas E Dutilh

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Bas E Dutilh

文章数：6篇

菌群-环境-健康

肠道菌群或是环境和健康之间的桥梁

在种族、性别认同和差异、社会经济地位低的弱势人群中，许多疾病的患病率更高。由环境带来的这种健康不平等现象值得探究。肠道菌群受宿主环境影响，并且具有个体/群体差异，或许是造成健康不平等的原因之一。在PNAS上发表的这篇文章，深入分析了环境-肠道菌群-健康三者之间的两两“依附"作用，并指出从生态角度调控肠道菌群改善健康不平等现象的可能性。该角度/观点值得相关人士参考。

菌群-环境-健康

肠道病毒组

Cell子刊：人肠道病毒组的稳定性和无麸质饮食的影响

Cell Reports近期发表的研究聚焦人肠道病毒组，分析了其组成、动态变化、个体差异和稳定性，特别探索了无麸质饮食对肠道病毒组的影响，并对研究方法进行了探讨。

肠道病毒组饮食干预

Cell子刊：噬菌体帮助细菌与宿主共生

有时候，被噬菌体感染，对于细菌来说是件好事，Cell Host and Microbe本期的封面文章就报道了这样一个例子。该研究分析了海绵的病毒组构成，发现其中的大量噬菌体可编码一种锚蛋白，感染细菌后经细菌表达，能减弱海绵宿主的抗细菌免疫，从而促进细菌与宿主共生。这类噬菌体不仅存在于海绵病毒组中，也存在于人体病毒组中。这些发现揭示了噬菌体在共生细菌与宿主互作中的新作用机制。

噬菌体共生海绵先天免疫免疫逃避

Nature子刊：全球尺度内人肠道病毒 crAssphage 的演化

crAssphage是在人肠道中发现的一种噬菌体，在2014年首次发现的时候，完全是一个新的噬菌体类群（没有已知的亲缘病毒株）。之所以叫这个奇怪的名字，是因为其基因组的组装是在一款名为“cross-assembly”的软件下完成的。crAssphage是人肠道中最丰富的噬菌体类型（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1079856040），也被作为人肠道病毒组的标志物（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1093737076）。本研究进一步揭示，这一噬菌体类型可能已经与人类休戚与共数百万年了。

肠道病毒人病毒组肠道病毒噬菌体 crAssphage噬菌体

环境代谢组

Nature子刊：由宏基因组数据预测代谢组

Nature Microbiology近期发表通信论文，介绍了一种利用宏基因组、单菌株代谢信息来精确预测环境代谢组的新算法，该算法准确预测了人体相关菌群的代谢组信息，并有望预测更加复杂环境的代谢组。该方法可拓展宏基因组的数据信息，有望为高效检测菌群代谢组提供助力，值得专业人士参考。

环境代谢组宏基因组机理建模 Melissa Brown Angela G Colantonio

FM：高盐生态系统中的噬菌体-原核生物宿主互作

关于病毒和细菌之间互作的研究，很值得读一读。

高盐环境噬菌体