C Hill

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文章数：2篇

Science子刊：宏转录组数据中被忽视的ssRNA噬菌体序列

噬菌体作为地球上数量最多的一种细菌病毒，人们对其种类的认识非常有限。传统的用于分离鉴定噬菌体的方法，因其通量低且对特定噬菌体具有偏好性，难以满足需要。而从微生物宏基因组/转录组数据中鉴定噬菌体序列则高效且全面得多。发表在Science advances上的一项研究，对已发表的微生物宏转录组数据进行ssRNA噬菌体基因组序列预测，鉴定了上万个新的ssRNA噬菌体基因组序列，其中接近完整的有1015个。该研究将ssRNA噬菌体的数量由目前的十几个扩展至了上千个，极大丰富了人们对于ssRNA多样性的认识。

宏转录组 ssRNA噬菌体基因组噬菌体蛋白隐马尔科夫模型

粪菌移植(FMT)

病毒（包括噬菌体）在FMT后的定殖发展

粪菌移植（FMT）可用于治疗复发性艰难梭菌感染，其成功通常归功于多样化微生物群的恢复。而病毒（包括噬菌体）是微生物群中数量最多且可能是最多样化的成员，但它们在FMT后的命运尚未得到很好的研究。本文研究了FMT后病毒的定殖发展，追踪个体噬菌体定植揭示了个体噬菌体的植入依赖于特定的供体-受体配对，当考虑FMT作为治疗选择时，病毒对长期微生物动力学的影响是应该考虑的因素。

粪菌移植(FMT) Faecal microbiota transplantation Bacteriophages Viruses Engraftment