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文章数：3篇

宏基因组组装基因组(MAGs)

STRONG：宏基因组菌株水平组装和分箱的新方法

本研究引入了一种新方法 STRONG（Strain Resolution ON Graphs），用于分析来自同一微生物群落的多个样本中的宏基因组序列。STRONG可以确定由所有样本的共组装分箱而成的MAG中“宏基因组菌株”的数量，以及它们跨多个单拷贝核心基因(我们称之为菌株单倍型)的序列，以及每个样本中每个菌株的覆盖率。STRONG通过使用一种新颖的变分贝叶斯算法BayesPaths直接在装配图上解析单倍型，避免了基于变分方法的局限性。

宏基因组组装基因组(MAGs) 单拷贝核心基因贝叶斯算法单倍型序列

DNA 测序技术

确定人类菌群研究中的偏差及其潜在解决方案

DNA 测序技术的进步极大地提高了研究人员探索人体菌群的能力。不幸的是，虽然这些研究揭示了菌群对我们健康的重要性，但它们往往不会得出类似的结果。在这篇综述中，作者重点介绍了典型的基于序列的人类菌群研究中可能引入显著偏差的各个步骤，并回顾了该领域目前旨在减少这些偏差影响的努力。作者建议目前研究中的所有方法应尽量保持一致，并且与以前的工作相比，应尽量遵循相同的实验方法，以确保基本结果对菌群测序实验中引入的偏差具有稳定性。

DNA 测序技术系统性偏差序列菌群测序校正

病毒基因组

Nature子刊：未培养病毒基因组的最少信息标准（MIUViG）

扩增子的最小信息标准发表在2011年的Nature子刊上（NBT：扩增子及其他测序的最小信息标准和测序规范(MIMARKS)），在最小信息标准发表后的2012年，扩增子测序逐渐开始蔓延，2015-2016年火热，在最近两年才慢慢平稳。时隔7年的2018年，同样在NBT上发表了病毒测序的最小信息标准。病毒研究确实是一个新领域，并且能看到这两年逐渐升温，新型冠状病毒的出现可能会加速病毒领域的研究，这将进一步加速病毒测序技术方法和生物信息学分析的成熟，相信大爆发时间不会太晚，也许在本年末，还是明年？反正是发展迅速并且很有前途的方向。我们是否也要当弄潮儿呢?

病毒基因组标准序列重叠群数据库