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吉林大学团队开发了基于深度学习方法的宏基因组病毒序列分类方法Virtifier

为了进一步提高从宏基因组数据中识别短病毒序列的性能，本文提出了一种基于深度学习的方法Virtifier。Virtifier在CAMI数据集和真实人体肠道宏基因组中的应用证明，它在识别长度小于500bp的病毒序列方面优于VirFinder、DeepVirFinder和PPR Meta。宏基因病毒序列检测是病毒分析的第一步，它对接下来的病毒分析工作有重大影响。Virtifier将在病毒分类和病毒性疾病检测领域发挥重要作用。Github上提供了Virtifier的Python实现和为本研究开发的Python代码 https://github.com/crazyinter/Seq2Vec 。

深度学习病毒序列分类器宏基因组病毒预测

VirSorter2：病毒组鉴定软件升级版发布

本文介绍了VirSorter2，这是一种DNA和RNA病毒识别工具，可利用自定义自动分类器集合中的基因组信息数据库更新来提高病毒序列检测的准确性和范围。通过多分类器和模块化设计，VirSorter2展示了主要病毒组之间更高的整体准确性，并将提高我们对各种生态系统中的病毒进化，多样性和病毒-微生物相互作用的了解。VirSorter2可以对测序数据中的所有类型的病毒进行可靠的检测并可以在大规模数据集中轻松检测到新的病毒多样性。这将使研究人员能够调查所有病毒在地球生物群系中所扮演的角色，并更好地了解这些病毒是如何限制基本微生物过程的。VirSorter2的源代码可以免费获得(https://bitbucket.org/MAVERICLab/virsorter2)。

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