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奶牛严重依赖其相关的胃肠道 (GIT) 微生物群来消化植物饲料，然而，奶牛GIT微生物组的区域特异性分类组成和功能以及饮食诱导效应的机制基础仍有待阐明。近日，南京农业大学的毛胜勇及团队在Microbiome发表最新研究，收集12头饲喂牧草和谷物的荷斯坦奶牛10个GIT区域（采集120个食糜样本）进行宏基因组测序，发现GIT微生物群主要分四腔胃、小肠和大肠三个集群，GIT微生物组的不同区域呈现特异性营养系统和饮食驱动的代谢灵活性，以适应营养可用性和能量获取，值得关注。

近日，南京农业大学毛胜勇及团队在ISME Journal发表最新研究，通过对18头奶牛的108个全肠道内容物样品测序，获得了372个MAGs参与胆汁酸解聚、氧化和去羟化途径。发现奶牛肠道不同部位的胆汁酸组成分布呈区段化特点，高精料日粮干预试验，发现Cluster1（对胆汁盐水解酶相关基因聚类获得）中BSH基因丰度增加与厚壁菌门菌株CAG-110有关，其丰度增加会促进胆酸浓度升高，与肠道炎症密切相关。总之，该研究进一步明确了奶牛肠道菌群代谢胆汁酸的基本规律，也揭示了日粮结构对微生物代谢胆汁酸及肠黏膜免疫稳态的影响，值得关注。

南京农业大学的毛胜勇、刘军花与团队在Microbiome发表最新研究，全面分析了参与反刍动物维生素B族和K2生物合成的胃肠道微生物基因和基因组，揭示了维生素生物合成在胃肠道中的分布特点和饮食的影响，并特别分析了菌群的钴胺（维生素B12）生物合成。这些发现有望为增强反刍动物胃肠道微生物的维生素B族和K2生物合成，提供新的解决方案。

作为反刍动物胃肠道附加的发酵场所，盲肠通常缺乏缓冲能力且上皮结构相对单薄。相关的微生物与上皮功能互作的研究不多。南京农业大学毛胜勇及团队近期在mSystem上对此进行了阐述，并提供了新见解。