基因注释

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文章数：4篇

全基因组测序（WGS）

iMeta：国内团队开发可交互微生物鉴定和溯源分析平台—MIST

本研究开发了一体化微生物鉴定系统MIST（http://syj.i-sanger.cn），MIST集成了三种分析流程：基于16S/18S/ITS扩增子的微生物鉴定、基于WGS（全基因组测序）的微生物鉴定和SNP（基于单核苷酸多态性）的微生物溯源追踪。作者还为MIST 开发了一个可公开访问的Web分析平台，用户可在线开展数据分析工作。

全基因组测序（WGS）单核苷酸多态性毒力因子基因溯源分析基因注释

细菌基因组学

Nature：大规模细菌基因功能预测

细菌基因组中，约1/3的蛋白编码基因缺少功能注释。上周Nature发表一项大规模研究，从32种细菌中，鉴定出超过一万个未知功能基因的突变表型，并通过比较序列分析，对这些基因的可能功能进行了预测。这些发现有助于推进对细菌基因功能的研究，值得专业人士关注。

细菌基因组学基因注释蛋白功能预测 Bacterial genomics Genetic techniques

Prokka细菌基因组和宏基因组基因注释流程

Prokka是一个神奇的软件，只有一个作者，发表5年引用3千多次可谓神作。目前在细菌菌组、宏基因组领域有非常广泛的应用。

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metaProdigal：宏基因组序列中的基因预测

由橡树岭国家实验室计算生物学与生物信息学小组开发的Prodigal是原核生物基因鉴定的流行软件，引用3千多次可谓神作。2012年开发的metaProdigal版本，改进了宏基因组中的基因鉴定能力，可作为宏基因组分析中基因鉴定步骤的推荐软件之一。

宏基因组基因注释