Christopher A Voigt

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Christopher A Voigt

文章数：7篇

Nature子刊：系统挖掘人体菌群，鉴定有不同活性谱的抗菌肽

与人类相关的细菌分泌修饰肽以控制宿主生理机能并重塑菌群组成。近日，发表在Nature Microbiology上的这篇文章，系统挖掘人体菌群并鉴定出具有不同活性谱的抗菌肽，表明人体菌群是具有独特活性谱的有效抗菌剂的来源。

抗菌肽

人原代结肠细胞

Nature子刊：人原代结肠与细菌共培养新方法

拟人化的模型系统可推进人肠道与细菌互作的研究。Nature protocol发表的文章，描述一种可用于共培养人原代结肠细胞和耐氧细菌的方法，用于更好的研究肠道微环境及屏障系统。

人原代结肠细胞共培养方法微环境其他

肠道菌群代谢产物

Nature子刊：肠道梭菌产生脂肪酰胺，或能调节人体生理

人体能通过产生内源性的脂肪酰胺（FAA）信号分子来调节生理过程，细菌也能合成FAA和其类似物。Nature Microbiology近期发表的一项研究，通过对人肠道微生物组进行挖掘，结合体外实验，发现一些梭菌编码的非核糖体肽合成酶样通路，能利用饮食等来源中常见的底物合成多种FAA。这些FAA能与人类的多种G蛋白偶联受体（GPCR）互作，或参与对人体生理的调控。

肠道菌群代谢产物脂肪酰胺肠道菌群 G蛋白偶联受体梭菌

体外共培养系统

体外研究微生物-肠道互作的新工具

在体外培养模型中研究肠道细菌（特别是对氧极为敏感的专性厌氧菌）调控宿主生理的机制，很具有挑战性。Med期刊近期发表来自美国MIT团队的研究，报道了一个可对专性厌氧菌和肠上皮进行体外长期共培养的新工具，并用其研究了有益菌普氏粪杆菌（F. prausnitzii）的抗炎作用机制。

体外共培养系统 gut microbiome Faecalibacterium prausnitzii oxygen-sensitive microbes microphysiological system

多形拟杆菌

Nature子刊：肠道多形拟杆菌基因回路的自动化设计

多形拟杆菌是一种人体肠道共生细菌，有望作为肠道中的治疗细菌。治疗性细菌需要具备根据肠道内外的情况开启不同的基因表达程序的特性。然而，在多形拟杆菌中缺少相应的可根据肠道环境自行调节基因表达的操作元件。Nature Biotechnology发表的文章，针对此问题进行了研究，报告了如何在多形拟杆菌中进行遗传电路的自动化设计。

多形拟杆菌合成生物学 Applied microbiology Bacterial synthetic biology Bacterial systems biology

Nature子刊：通用型细菌合成生物学新工具

相比于自然界数量庞大的微生物种类，目前合成生物学所使用的驯化微生物种类极其有限。遗传操作工具的匮乏限制了人们对这些具有优良性状的未驯化微生物的利用。发表在《Nature Microbiology》上的一项研究，利用整合性接合元件开发了一种名为XPORT的工程枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），它能以高度的精确性和可控的方式将DNA传递给各种细菌。XPORT已被证明能直接转化35种不同的细菌（包括人类皮肤、肠道细菌），并且能直接转化土壤中的天然细菌，为不可培养细菌的直接工程化开辟了可能性，并对促进人类健康和农业发展具有重要意义。

遗传工程整合性接合元件枯草芽孢杆菌 DNA转移 T4SS

Cell：肠道菌群代谢产物抑制宿主蛋白酶活性

Cell又有新的菌群文献发出！通过生物信息学分析，从肠道细菌中鉴定出非核糖体短肽合成酶的基因簇，将其中一些基因在大肠杆菌和枯草杆菌中表达，发现表达的酶释放的生物活性物质会抑制宿主的蛋白酶。这是一项重磅研究，通过生物信息学分析得到菌群里的基因信息，进而可以了解细菌的代谢产物对宿主的的影响，很了不得，这或许是菌群研究全面进入分子机制的开端之作之一。周末放毒，强烈推荐！

代谢产物短肽合成酶二肽醛生物信息学合成生物学