肠道菌群

生命早期的免疫-微生物互作可影响过敏、哮喘和其他炎症性疾病的风险。Cell最新发表的一项研究表明，缺乏双歧杆菌及其母乳寡糖利用基因，与生命早期的系统性炎症和免疫失衡相关，但给婴儿补充一种益生菌——婴儿双歧杆菌EVC001可缓解这一问题，并揭示了该菌调节免疫的潜在分子机制。这些发现为深入理解双歧杆菌对生命早期免疫发育的调控作用和机制，以及研发相关干预方法，带来了新启示。

免疫发育双歧杆菌肠道菌群生命早期

中风

Cell子刊：肠道菌群通过TMAO途径影响中风

肠道菌群可通过CutC酶将膳食胆碱转化为三甲胺（TMA），后者进一步在宿主体内衍生代谢为氧化三甲胺（TMAO）。研究显示TMAO与中风风险存在关联，但其因果性尚未得到证实。Cell Host and Microbe最新发表的一项研究表明，肠道菌群可通过胆碱-TMA/TMAO途径，影响宿主的中风严重程度。这些发现为预防和治疗中风提供了新的潜在干预靶点。

中风肠道菌群 TMAO

肠道免疫

江南大学孙嘉团队：靶向肠道菌群-CRAMP轴或可治疗乳糜泻

肠道免疫研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）乳糜泻

色氨酸代谢产物

糖尿病与哪些色氨酸代谢产物有关？

色氨酸可通过宿主的犬尿氨酸途径和微生物的吲哚途径，代谢为不同的代谢产物，对宿主生理功能产生重要影响。Gut最新发表的一项研究，通过对多种族的5个队列样本进行分析，鉴定出与2型糖尿病相关的色氨酸代谢产物，并进一步揭示了与这些代谢物相关的宿主遗传、饮食和肠道菌群因素。其中，高膳食纤维和特定人群中的牛奶摄入，可能通过宿主-菌群互作将色氨酸代谢转为产生吲哚丙酸，从而发挥对糖尿病的预防保护性作用。

色氨酸代谢产物肠道菌群遗传饮食吲哚丙酸

2型糖尿病

上海六院：瘦人患2型糖尿病，缺乏Akk菌或是关键

尽管大多数2型糖尿病（T2D）患者均表现为肥胖，但有一部分患者的体重正常甚至消瘦。研究显示T2D和肥胖都伴随着肠道菌群的改变，且这些改变对疾病的发生和发展均发挥着重要的作用，但是消瘦型T2D的肠道菌群的变化以及在这一类型疾病发展的作用并不明确。近期上海交通大学附属第六人民医院贾伟平、李华婷与研究团队在Advanced Science上发表研究，通过对T2D消瘦型患者肠道菌群的分析，联合小鼠模型验证的结果显示，消瘦型T2D患者存在Akk菌的减少，该菌的减少与胰岛素分泌和葡萄糖平衡的损害有关。这些结果糖尿病的预防和精准治疗提供的重要的理论依据。

2型糖尿病消瘦型II型糖尿病肠道菌群胰岛素分泌研究论文

三代测序技术

同济大学团队：三代测序技术助力研究人肠道菌群

尽管进行了数十年的研究，但人们对肠道菌群的组成仍知之甚少。本研究中，作者建立了一种获得高质量的肠道菌群基因组的有效提取方法，并使用第三代测序技术对其进行分析。通过这种方法，作者不仅发现了大量未知基因，还识别了几个新的亚种和物种。这项工作为探索肠道菌群基因组提供了一种新颖可靠的方法，促进了新细菌物种的发现，其进一步加深了人们对构成人类健康和疾病基础的菌群的理解。

三代测序技术肠道菌群重叠群细菌基因组条件病原体

诊断模型

张家超等：基于肠道菌群标志物诊断格雷夫斯病

格雷夫斯病（GD）又称“毒性弥漫性甲状腺肿”，是一种自身免疫疾病的多系统综合征，通常引起甲亢。目前GD的临床诊断较为耗时，且可能与帕金森病混淆，因此需要研发便捷、准确的诊断方法。海南大学张家超团队、Kaining Chen团队与Rob Knight团队合作，在ISME Journal发表文章，对GD患者肠道菌群特征进行分析，鉴定出具有疾病特异性的GD菌群标志物，构建了疾病诊断模型，具有临床应用潜力。

诊断模型格雷夫斯病自身免疫疾病肠道菌群

饲料效率

中国农大：肠道菌群+宿主遗传，共同影响鸡的饲料效率

如何提高饲料效率是动物养殖业的关键问题。中国农业大学杨宁、孙从佼与团队近期在Microbiome发表研究，分析了206只鸡的遗传、不同肠段肠道菌群以及二者的关联和对饲料效率的影响，表明虽然宿主基因对整个菌群的影响有限，但一小部分肠道微生物可与宿主基因相互作用，共同提高饲料效率。这些发现或有助于研发改善鸡饲料效率的新方法。

饲料效率鸡肠道菌群遗传-菌群互作

代谢建模

研究菌群代谢功能的新模型

Gut Microbes近期发表研究，提出了一种新的模型来研究菌群的代谢功能，并用其分析了梭杆菌属细菌在肠癌中的代谢作用。

代谢建模肠道菌群

SARS-CoV-2/COVID-19

国内团队：COVID-19感染导致儿童上呼吸道和肠道菌群持续失衡

与成人相比，儿童对新冠病毒（SARS-CoV-2）相对不易感，感染SARS-CoV-2是否以及如何影响儿童的菌群目前尚不清楚。2021年5月29日，JGG在线发表了JGG在线发表了复旦大学附属上海市公共卫生临床中心张驰宇教授、云南大学张志刚研究员和复旦大学附属儿科医院徐锦研究员的研究论文。该研究报道了COVID-19感染引起儿童上呼吸道和肠道菌群的持续扰动和失衡。该研究针对9个新冠感染儿童的上呼吸道和肠道菌群的动态演化进行了持续近2个月的观测和分析，包括急性、中间和恢复期。

SARS-CoV-2/COVID-19 上呼吸道菌群肠道菌群生态失调儿童

结直肠癌

工程益生菌：肠癌药物递送+调节肠道菌群

细菌可用来运送抗癌药物，但使用减毒致病菌会有毒性或感染的风险。乳酸菌安全可食用且通常对健康有益，是运送抗癌药物活载体的理想选择。Microbiome近期发表的文章，基于乳酸菌——戊糖片球菌，开发出一种递送P8治疗蛋白的工程益生菌给药系统，可在小鼠模型中抑制结直肠癌，并促进肠道菌群恢复平衡。

结直肠癌工程性益生菌肠道菌群药物递送

肝胆疾病

仁济医院：两种硬化性胆管炎中，粪便菌群和代谢组的改变和差异

肝胆疾病自身免疫疾病肠道菌群代谢组诊断模型

女性健康

肠道和阴道菌群与性类固醇：对女性健康的影响（综述）

Trends in Endocrinology and Metabolism近期发表综述，总结了肠道和阴道菌群与性类固醇之间的相互作用，及其对女性不同生命阶段的健康和疾病的影响。

女性健康雌激素肠道菌群阴道菌群

食源性肥胖

Cell子刊：肠道菌群影响食源性肥胖和下丘脑炎症的新机制

缺乏菌群的小鼠可以抵抗食源性肥胖。此前研究表明，西式饮食会导致下丘脑炎症，进而导致瘦素抵抗和体重增加。近期发表于Cell Reports的一项研究发现，清除小鼠的肠道菌群能通过GLP-1R依赖性机制，减轻西式饮食诱导的下丘脑炎症、增强瘦素敏感性。

食源性肥胖肠道菌群 GLP-1 肠-脑轴

急性髓系白血病（AML）

Nature子刊：自体粪菌移植恢复AML患者的肠道菌群多样性

急性髓系白血病（AML）经高强度化疗联合广谱抗生素，导致肠道菌群失调，促进病理状态，增加并发症的发生率。Nature Communications近期发表的文章，报道了一项利用自体粪菌移植（AFMT）治疗AML患者（经过化疗和抗生素治疗）的多中心单臂的II期临床试验，AFMT能够恢复病人失调的肠道菌群，说明对于接受高强度化疗和抗生素治疗的AML患者，AFMT用于恢复患者的肠道菌群是安全且有效的，在菌群丰富度和多样性系数等指标显示，AFMT很好地对患者的肠道菌群进行重建。

急性髓系白血病（AML）粪菌移植肠道菌群

肠道菌群

GutSMASH：自动识别肠道菌群中的主要代谢基因簇的网站

人类菌群中厌氧细菌衍生的初级代谢物很重要，但不存在预测负责其产生的基因簇的工具。为此，本文推出了gutSMASH。GutSMASH 可以预测 41 种不同的已知途径，包括涉及生物能量学的初级代谢基因簇 (MGC)。为了使该工具更加用户友好和易于访问，作者开发了gutSMASH网络服务器，网址https://gutsmash.bioinformatics.nl/。用户可以输入 GenBank 程序集登录名或上传 FASTA 或 GenBank 格式的基因组文件。或者，用户可以启用其他分析，以进一步了解预测的MGC。交互式 HTML 输出提供了一种用户友好的方式来浏览功能基因注释和与参考基因簇以及其他基因组中预测的基因簇的序列比较。因此，该网络服务器提供了一个简化且用户友好的界面，以分析肠道菌群的代谢潜力。

肠道菌群代谢基因簇 GutSMASH网络服务器功能基因注释数据库

结肠炎症

浙江中医药大学团队：灵芝多糖（GLP）或可抑制结肠炎症和肿瘤发生

来自浙江中医药大学的王兴亚团队在Carbohydrate Polymers发表文章，证明了从灵芝孢子粉中提取水溶性多糖（GLP）可缓解AOM/DSS诱导的结肠炎，抑制肿瘤发生，同时调节肠道菌群。提示GLP是一种具有前景的治疗结直肠癌的益生元。

结肠炎症结直肠癌灵芝多糖肠道菌群免疫细胞

豆类食物

Cell子刊：豆类食物摄入对严重营养不良儿童或有益

本研究通过随机对照试验，旨在探索针对营养不良儿童，补充摄入豆类食品是否可以保护儿童肠道完整性，并改善微生物群。本研究在表型上，包括体重增重、降低儿童死亡率等方面，并没有观察到显著作用，但是其在儿童肠道菌群的改变中，观察到细微的良性改变。本研究样本量较小，有必要针对该话题进一步探索。

豆类食物儿童营养不良体重增重肠道菌群

二甲双胍

二甲双胍如何影响肠道菌群和SCFA？

二甲双胍肠道菌群短链脂肪酸

潘氏细胞

Cell子刊：西式饮食如何伤肠？新机制被揭示

肠道潘氏细胞是肠道先天免疫的“守门人”，其功能缺陷可引起肠道炎症，增加发生感染和炎症性肠病（IBD）的风险。Cell Host and Microbe发表的一项最新研究，揭示了促肥胖的西式饮食引起潘氏细胞缺陷的机制，阐述了肠道菌群、胆汁酸、FXR和1型干扰素信号通路在其中的作用，为理解IBD等与潘氏细胞缺陷有关的肠道疾病机理，带来了新启示。

潘氏细胞西式饮食肠道菌群

肠-脑轴

缺乏激情和动机与肠道菌群有何关联？

缺乏快感和动机在人群中的发生率约15~20%，尤其常见于抑郁、精神分裂和慢性疲劳等相关疾病患者中。Molecular Psychiatry近期发表研究，通过中介模型分析发现，内源性大麻素介导了肠道菌群多样性与快感缺乏/无动机之间的关联，为研究相关疾病的机理和治疗提供了新线索。

肠-脑轴肠道菌群内源性大麻素系统抑郁

营养不良

营养不足时，菌群如何调节宿主的代谢变化

PNAS近期发表了Jeffrey Gordon团队的研究，在由孕期和生命早期饮食限制引起的营养不良模型猪和悉生小鼠中，研究了肠道菌群对宿主体重增长减缓和机体代谢改变的影响，对进一步研究优化动物养殖有一定参考意义。

营养不良代谢调控肠道菌群猪

肺癌

肺癌研究论文基础研究医学研究恶病质

益生菌递送

刘尽尧团队：新型益生菌口服递送技术——激肠道免疫，促菌群健康

健康的肠道菌群可帮助宿主抵抗肠道感染、保护肠道屏障，但目前仍缺少有效维持肠道菌群稳态的直接干预方法。Science Advances最新发表了来自上海交通大学刘尽尧团队的研究成果，报道了一种新型益生菌口服递送技术，可将益生菌递送至肠道派氏结内，从而能通过激发肠道黏膜免疫反应，来帮助肠道菌群在扰动因素下（如致病菌感染、肠道损伤）维持健康稳态，保护肠道屏障功能。

益生菌递送肠道黏膜免疫肠道菌群肠屏障

疟原虫感染

肠道菌群通过调控“远端”免疫系统，影响疟原虫感染

肠道菌群在生命的早期就对局部和远端免疫系统进行了“塑造”，即能对整个生命周期的免疫进行长期调控，又能动态的调节局部免疫；然而目前，对于在胃肠道外感染的情况下，肠道菌群是否能对远端免疫进行调控，仍不清楚。Cell Reports发表的一项研究表明，在疟疾感染小鼠模型中，寄生虫的承载量和脾脏生发中心的反应是由肠道菌群的信号传递并调控的，该研究证实了肠道菌是可以通过影响远端免疫，进而对疟原虫感染起到调控作用的。

疟原虫感染肠道菌群远端调控研究论文基础研究

睡眠

国内团队：睡眠不足促炎伤脑，肠道菌群有关键作用

睡眠不足在快节奏的现代社会中越来越普遍。研究表明，睡眠不足可导致炎症反应失调和认知功能障碍，但其机制尚不清楚。Molecular Psychiatry近期发表了来自北京大学韩盈、陆林、Wei Yan和中山大学一附院魏泓与研究团队的文章，表明肠道菌群失调在睡眠剥夺引起的炎症反应和认知损害中有重要作用，为减轻睡眠不足的不良健康后果提供了新的干预思路和靶点。

睡眠肠-脑轴认知功能炎症反应肠道菌群

真菌感染

Nature子刊：β-内酰胺类抗生素如何增加白色念珠菌感染风险

白色念珠菌存在于正常的人体肠道菌群中，通常不会引发感染，但在一些风险因素（如免疫功能低下、黏膜屏障损伤以及广谱抗生素治疗）存在时可能引发致命的感染。Nature Communications近期发表的一项研究，揭示了β-内酰胺抗生素促进白色念珠菌感染的一种机制，表明共生菌群释放的肽聚糖风暴在其中有关键的介导作用。

真菌感染抗生素肽聚糖白色念珠菌肠道菌群

沙雷氏菌

Nature子刊：中科院植生所发现蚊子肠道中的抗疟疾新武器

疟疾是流行于非洲、美洲、亚洲的热带和亚热带地区的寄生虫病，抗疟疾方法的研发依然迫在眉睫。Nature Microbiology近期发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心王四宝研究团队的研究工作，从中华按蚊肠道内发现了具有天然抗疟活性的共生细菌——解脲沙雷氏菌（Serratia ureilytica）菌株Su_YN1，阐释了该共生菌通过分泌抗疟蛋白脂肪酶AmLip杀灭疟原虫的分子机制。该研究为理解按蚊肠道菌抗疟机制提供了新见解，也为从源头阻断疟疾传播提供了潜在新武器。

沙雷氏菌云南腾冲脂肪酶AmLip 疟疾中华按蚊

多囊卵巢综合征

上海交大医学院：PCOS中的肠道菌群失调如何影响代谢和内分泌

多囊卵巢综合征（PCOS）是一种常见的生殖内分泌紊乱，患者经常表现出肠道菌群失调。上海交大医学院附属仁济医院的杜艳芝和陈子江院士与团队，近期在Microbiome发表研究，在模型大鼠中揭示了由雄性激素诱导的肠道菌群变化在PCOS发病机制中的代谢和激素调节作用。

多囊卵巢综合征肠道菌群

结直肠癌

房静远团队：ZFP90经肠道菌群促进肠炎相关肠癌的发生

慢性炎症和肠道菌群失调是结直肠癌的危险因素。在临床实践中，炎症性肠病（IBD）患者发生结肠炎相关结直肠癌（CAC）的风险大大增加。然而，CAC的启动机制尚不清楚。上海交通大学房静远团队在Gut Microbes上发表文章，Zfp90是CAC发展的致癌基因，且Zfp90的致癌作用依赖于肠道菌群，尤其是普氏菌（P.copri）为主的菌群。Zfp90通过TLR4-PI3K-AKT-NF-κB信号通路，介导CAC的发生。研究揭示了Zfp90-肠道菌群-NF-kB轴在CAC发生过程中的重要作用，或可作为CAC预防和治疗的靶点。

结直肠癌 ZFP90 肠道菌群