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Didier Ndeh
文章数:4篇
肠道细菌
岩藻糖苷酶助力瘤胃球菌在肠道内定殖
胃肠道内经过唾液酸化和岩藻糖基化作用的多糖能被肠道内的细菌选择性利用,有助于成人和婴儿肠道菌群的组成。尽管岩藻糖在调节成人和婴儿肠道细菌定殖方面很重要,但从人类肠道共生体的生化水平上研究的岩藻糖苷酶数量十分有限。发表在《Cellular and Molecular Life Sciences》上的一篇文章中,研究人员鉴定了一种来自瘤胃球菌(R. gnavus)的岩藻糖苷酶,该酶能够识别被唾液酸覆盖的岩藻糖基化聚糖,并能水解这些底物中的α1–3/4岩藻糖基键,而无需除去唾液酸。这种独特的特异性可能有助于R.gnavus菌株适应不同的营养生态位。由于人多糖上唾液酸岩藻糖基化表位丰度的变化与多种疾病有关,如糖尿病和某些癌症,这些新型岩藻糖苷酶可能在诊断糖组学分析中具有潜力。
肠道细菌
Gut microbiota
glycoside hydrolase
Mucus
Mucin glycosylation
菌群-代谢物
Nature子刊:多形拟杆菌中糖胺聚糖代谢途径解析
糖胺聚糖(GAG)是多形拟杆菌(B.thetaiotaomicron)主要的优先利用营养素。按单糖残基、残基间连键的类型以及硫酸基的数目和位置,GAG可分为5个主要类别:透明质酸(HA)、硫酸软骨素(CS)、硫酸皮肤素(DS)、硫酸角质素(KS)及硫酸乙酰肝素和肝素(HP)。尽管HP代谢途径以及参与CS代谢的酶已有报道,但CS、DS、HA的代谢途径以及各个酶之间是如何协调作用的还不清晰。发表在《Nature Communications》上的一篇文章对多形拟杆菌的多糖利用基因座(PUL)进行了深入研究,鉴定了两个新的GAG结合蛋白,与多糖裂解酶(PL)协同作用促进GAG利用。并进一步研究了不同PL及其对应突变体的底物利用度、硫酸酯酶的三维结构以及PUL在不同拟杆菌的分布情况,填补了肠道细菌在糖胺聚糖代谢方面的空白。
菌群-代谢物
多形拟杆菌
糖胺聚糖(GAGs)
多糖利用基因座
GAG结合蛋白
聚糖
FEMS MR:肠道菌群如何降解复杂聚糖?(综述)
这是FEMS Microbiology Reviews[IF:12.198]发表的重要综述,系统性阐述了肠道菌群对各种植物或动物来源的复杂聚糖的降解作用,对关注肠道菌群相关代谢的人来说,这篇综述或许是篇宝贝。好好读读哈!
聚糖
Glycoside hydrolases
enzymology
Human gut microbiota
nutrient cross feeding
拟杆菌属
Nature子刊:多形拟杆菌是怎样降解果胶多糖的?
这是Nature Microbiology发表的关于人体结肠拟杆菌属降解复杂的果胶多糖的机制研究,这是益生元代谢相关分子机制研究的代表作,值得特别关注。
拟杆菌属
果胶多糖
多糖利用位点
多形拟杆菌