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Ayesha Noorani
文章数:2篇
食管腺癌
Nature子刊:食管腺癌转移克隆散居模型理论再添证据
癌细胞转移扩散到远端位点是癌症死亡的主要诱因,了解疾病的解剖范围对确定最佳治疗策略至关重要。食管腺癌(EAC)发病率急剧上升,已成为发达国家食管癌的主要亚型。理论和实验研究试图了解肿瘤细胞群如何随着时间的推移对选择性压力做出反应,目前已提出了许多肿瘤进化模型,包括线性、分支、中性和间断进化,但这些模型对特定癌症类型的特异性或同时发生的程度具有争议。许多基因组测序研究试图描述不同的进化模式,但这些研究仅关注于原发部位的进化,而对遗传多样性如何在转移过程中出现的认识仍然有限。对此缺乏了解的部分原因在于,在时间和空间上从晚期癌症患者收集多个样本具有实际挑战。为更好地理解EAC的演变,最新发表在Nature Genetics杂志的文章设计了一项前瞻性研究:随着时间的推移,进行了广泛的采样,包括来自诊断和手术的样本,以及快速收集的尸检样本。利用高深度和浅跨度全基因组测序(WGS),跨时间和空间建立克隆架构。在90%的患者中,原发肿瘤的多个亚克隆从原发部位迅速扩散,形成多个转移,“无性繁殖散居”的传播模式。
食管腺癌
全基因组测序
克隆
亚克隆
转移
结直肠癌
Nature:结直肠癌变之前的体细胞突变
目前对结直肠腺瘤-癌的测序为理解连续性的体细胞遗传改变及致癌克隆扩增提供了一个较为全面的框架。然而,对于结直肠细胞以及其他组织细胞最初新生改变的理解还比较模糊,这些改变可能发生在形态正常的组织中。最新发表在Nature杂志的一项研究,从42名年龄在11-78岁参与者的正常上皮组织中分离出2035个结肠隐窝,并对其基因组测序。该发现揭示了多个突变过程的特征,其中一些是普遍存在且和连续的,而另一些只出现在某些个体的某些隐窝中或出现在生命的某个时期。在中年人中,大约1%正常结直肠隐窝中存在可能的肿瘤驱动突变,这表明腺瘤和癌是正常结直肠上皮中普遍存在的致瘤改变过程的罕见结果。与正常细胞相比,结直肠癌的突变负担明显增加。正常结直肠细胞测序为肿瘤的基因组和克隆进化提供了定量分析。
结直肠癌
结直肠腺瘤
基因组测序
突变特征
突变负担