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计算宏基因组学

宏基因组学和宏转录组学定量分析工具AGAMEMNON

AGAMEMNON是一种节省时间和空间的计算机框架，可用于分析宏基因组/宏转录组样本，在属、种和菌株分水平上提供高准确度的微生物丰度估计，其新颖的索引方案和分析引擎使我们能够通过提供微生物丰度估计来超越分类等级，同时绕过类似的基于比对的量化方法的巨大内存需求。AGAMEMNON 可在以下网址获得：https://github.com/ivlachos/agamemnon

计算宏基因组学菌群定量微生物丰度污染物识别时间和空间高效的索引/比对