Sara Saheb Kashaf

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Sara Saheb Kashaf

文章数：3篇

皮肤微生物

母婴皮肤微生物组新突破

本研究通过对母婴皮肤微生物的深度测序，在一定程度上揭示了婴儿皮肤微生物的特征，对未来皮肤微生物组学研究、母婴健康干预研究均具有重要的意义。

皮肤微生物研究论文婴儿母亲菌群

皮肤微生物组

Nature子刊：细菌培养和宏基因组学结合，助力皮肤微生物组研究

人类皮肤微生物组的变化与痤疮和特应性皮炎等皮肤病有关。有研究对皮肤微生物组在健康或疾病中的作用进行的宏基因组调查发现，许多测序数据与参考基因组不匹配，使得宏基因组数据集难以解释。Nature Microbiology发表的研究，将培养方法与宏基因组分析相结合，建立了皮肤微生物基因组集（SMGC），其中包括从7535个metagenome-assembled genomes（MAGs）中鉴定出来的622个原核生物物种，以及251个培养的细菌基因组，12个真核生物基因组和数千个非冗余病毒序列。通过SMGC，可以更精细的描述人类皮肤样本中微生物的多样性。本研究或可帮助我们增加对皮肤微生物群在健康方面的认识，并设计治疗方法来对抗与微生物相关的皮肤疾病。

皮肤微生物组细菌培养宏基因组

鸟枪宏基因组测序

Nature子刊：宏基因组中挖掘原核基因组的分析流程

在本方法中，作者使用 Almeida 等人探索的宏基因组数据集的一个子集展示了从宿主相关的短读长鸟枪宏基因组测序数据中恢复原核基因组的流程。作者简要讨论了这些方法如何应用于其对人类皮肤菌群的研究。本方法的重点主要是工具的具体应用，而不是讨论工具的所有可能的输入和输出。在故障排除部分，作者还讨论了可能出现的部分问题，但作者预计其他问题可以在与每个工具关联的 GitHub 问题部分中解决，或者如果适用，在与此方法关联的 GitHub (https://github.com/Finn-Lab/MAG_Snakemake_wf ）。

鸟枪宏基因组测序原核基因组宏基因组组装的基因组分析流程组装