单碱基精度

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国内团队Nature子刊：鉴定及定量菌群样品中细菌的新方法——BarBIQ

中科院动物所金坚石与团队近期在Nature Protocols发表研究，为了克服传统16S rRNA基因测序方法的局限，作者开发了BarBIQ方法，这是一种对菌群中单个细菌进行高通量鉴定和定量的方法，该方法采用条形码标记单细菌的策略并实现了对16S rRNA基因鉴定的单碱基精确度。本文以BarBIQ在小鼠肠道菌群分析中的应用为示范。

菌群定量细胞条形码 16S rRNA基因单碱基精度生物信息学分析流程

高通量鉴定

BarBIQ：菌群中单菌的高通量鉴定和定量的新方法

BarBIQ（条形码细菌的鉴定和定量 )方法基于具有单碱基精度的细胞条形码 16S rRNA 序列，将单个细菌细胞划分为分类群——本文命名为基于细胞的可操作分类单元 (cOTU)，并以高通量方式量化菌群中每个 cOTU 的细胞数。BarBIQ 是一种被开发的高通量和准确的方法，在单细胞水平上定义了菌群，可用于与菌群相关的广泛研究领域。BarBIQ 可以准确地可视化全体菌群和单个细菌成员，将有助于有效了解菌群的功能。

高通量鉴定细菌菌群单碱基精度定量 cOTU