丁涛
中山大学中山医学院教授,博士生导师
中山大学“百人计划”引进人才,中组部第十四批“千人计划”青年项目入选者
流感病毒感染期间患者上呼吸道的抗生素耐药性及宿主-菌群互作
① 纳入37名流感病毒感染患者(25名感染H3N2、6名感染H1N1、6名感染乙型流感病毒),收集鼻拭子、咽拭子及血液样本;② 根据呼吸道菌群的基因表达谱可将患者分为2组,并鉴定出2组患者菌群组成、功能通路及抗生素耐药基因的差异;③ 部分细菌属与特定抗生素耐药基因的表达相关,例如链球菌属及莫拉克斯氏菌属与β-内酰胺耐药基因呈正相关,葡萄球菌属与四环素耐药基因呈负相关;④ 宿主对于流感病毒感染的应答与呼吸道菌群组成及基因表达相关。
03-17
丁涛:流感病毒感染及疫苗接种状态影响鼻咽菌群组成
① 收集215名感染了甲型流感病毒(H3N2)或乙型流感病毒的受试者的鼻咽样本,分析鼻咽菌群组成;② 感染流感病毒的类型与鼻咽菌群的组成显著相关;③ 是否接种过流感病毒疫苗也与鼻咽菌群组成相关,并受到感染流感病毒类型的影响;④ 在未接种过疫苗的老年感染者中,鼻咽菌群中7个分类群的丰度显著升高,其中狡诈菌属及葡萄球菌属与肺炎相关;⑤ 在健康人及感染者中共鉴定出4中不同的鼻咽菌群群落类型,健康人的群落类型集中分布于其中一种。
2019-07-02
感染结核病对模式动物(猕猴)呼吸道菌群的影响
① 分析了26只猕猴的支气管冲洗物,研究结核菌感染引起的呼吸道菌群变化;② 菌群多样性在感染初期(1个月)增加,感染后期(5个月后)恢复正常;③ 在感染第4个月(结核病已确立)有3个核心菌群丰度发生显著变化,分别是SR1、伴放线放线杆菌(上升),以及毛螺菌科(下降);④ 不过,菌群丰度和结构与肺部炎症或肺叶受累无关;⑤ 共现网络分析发现结核菌感染改变了菌群的相互作用关系,促成了放线菌在感染后样本中的9个新连接(2正7负)。
2018-10-09
mBio:粪菌特征或可预测优特克单抗治疗克罗恩病的效果
① 在22周的优特克单抗治疗时期内,收集克罗恩病患者的粪便样本;② 利用基于患者的基础菌群组成及临床数据训练随机森林模型,可在治疗6周后鉴别出对治疗产生应答的患者;③ 栖粪杆菌属和埃希氏菌属/志贺氏菌属是最具预测能力的OTU,在6周后对治疗产生应答的患者粪便中,其基础丰度升高;④ 在6周后对治疗产生应答的患者,其基础粪菌多样性是未应答患者的1.7倍;⑤ 在22周的试验时期内,对治疗产生应答的患者的菌群多样性呈上升趋势。
2018-03-13
中山大学中山医学院教授,博士生导师
中山大学“百人计划”引进人才,中组部第十四批“千人计划”青年项目入选者
2006,中国科学技术大学生命科学学院,学士学位
2012,俄克拉荷马州立大学,生物化学与分子生物学博士学位
2012.12-2014.3,密歇根大学,博士后研究工作
2014.4-2018,纽约大学,博士后研究工作
微生物组在传染性或慢性疾病(特别是呼吸道疾病)中的动态和功能机制
呼吸道微生物组与肠道微生物组(肠道菌群)之间的协同机制,以及针对宿主免疫的协同应答
基于微生态学和微生物组学大数据的生物信息学和建模等