宏基因组样本

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微生物富集法

Nature子刊：微生物富集法或可助力处理高宿主率宏基因组样本？

宿主-微生物互作已经通过微生物分类分析与健康和疾病状态联系起来，主要是通过16S rRNA基因测序。然而，许多机制的见解仍然难以捉摸，部分原因是研究与哺乳动物组织相关的微生物基因组是困难的，因为这些样本中宿主与微生物DNA的比例很高。近日，美国加州理工学院研究人员在Nature Methods发表最新研究，描述一种微生物富集法，利用宿主和细菌细胞间的大小差异，利用机械应力（头部敲打）结合选择性裂解方案，进而有效去除高宿主率样本，在多个样本中测试性能较好，值得关注。

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Nature子刊：估算肠道菌群生长阶段的新方法

粪便的纵向采样研究对人们了解人类肠道微生物组的生态动力学十分重要。但大部分的采样都是每天一次的频率，而共生菌的增殖、翻倍发生在分秒之间。二者的时间轴并不匹配。针对此，Nature communications发表的文章提供了一种新的估算方法。

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