Matthias Scholz

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Matthias Scholz

文章数：5篇

低FODMAP饮食

Gastroenterology：低FODMAP饮食缓解IBS患者症状

① 104名肠应激综合征（IBS）患者随机分成4组：假饮食+安慰剂、假饮食+益生菌、低FODMAP+安慰剂、低FODMAP+益生菌；② 4周后，饮食干预与症状缓解及双歧杆菌均无显著关联；③ 与假饮食组相比，低FODMAP饮食组症状缓解比例较高、IBS严重性平均得分降低、粪便双歧杆菌属丰度降低，粪便菌群多样性无变化；④ 与安慰剂组相比，益生菌组IBS严重性平均得分无变化、粪便双歧杆菌属丰度升高；⑤ 低FODMAP饮食可适当缓解症状，联用益生菌有助双歧杆菌重建。

低FODMAP饮食益生菌双歧杆菌属肠易激综合征 food sensitivity

尿路致病性大肠杆菌

Cell Reports：菌株水平研究的新方法

新方法，又可以在宏基因组数据中分析出新结果。

尿路致病性大肠杆菌坏死性小肠结肠炎早产婴儿宏基因组测序菌株水平

Nature子刊重磅：从宏基因组信息鉴别菌株信息！

① 本文介绍了一种利用宏基因组数据完成菌株鉴别的工具——PanPhlAn；② PanPhlAn根据一个物种的泛基因组，确定在一个物种的不同菌株中有无哪些基因，可得到菌株功能及其致病潜能；③ PanPhlAn能识别造成疾病爆发的菌株，且可对已知菌株和新菌株进行鉴定和比较；④ 结合转录组数据，PanPhlAn能分析相应菌株在复杂的群落中的转录活性；⑤ PanPhlAn克服了宏基因组组装相关的局限性，即使对于参考基因组很少的物种，也能很好地进行菌株鉴定。

宏基因组菌株鉴定

SR：为什么双歧杆菌代谢糖类的能力更强？

对47个代表性的双歧杆菌进行基因组分析，发现双歧杆菌与糖代谢吸收有关的基因多于肠道其他菌群，双歧杆菌多糖代谢能力被认为可以反映哺乳动物肠道可用碳的水平，这或许也是双歧杆菌在人体肠道里行使重要作用的机理之一，这篇老文章，强烈推荐大家看一看。

双歧杆菌糖代谢碳源

Nature子刊：宏基因组物种分类和定量工具MetaPhlAn2

MetaPhlAn2是基于标记基因的快速物种分类和定量工具，由哈佛大学Curtis Huttenhower团队和意大利特轮托大学Nicola Segata(出自Curtis Huttenhower组)团队共同出品，是MetaPhlAn工具的升级版，截止19年9月4日软件两版累计引用1335(853+482)次。是肠道宏基因组研究中物种组成分析的首选工具。日报之前报导过的相关工具还有《MGX框架——宏基因组分析的新方法》（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1075688938）、想要专门分析病毒组，有《Nature子刊：分析病毒组的新工具》（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1081676963）等。

宏基因组宏基因组序列分类宏基因组物种分类标记基因