定量PCR

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相对丰度会歪曲实际丰度，联合16S扩增子测序和总菌qPCR获得的绝对丰度可靠吗？

微生物组研究主要使用16S rRNA基因扩增子测序来评估细菌类群的相对丰度。但是16S rRNA基因扩增子测序不能准确反映物种的绝对丰度。本研究试图确定通过细菌16S通用引物qPCR获得总细菌载量和16S rRNA基因扩增子测序获得的物种相对丰度的两者乘积是否可以准确地代替特异性qPCR所检测的单个物种的绝对丰度。总体而言，基于两种技术联合推断的特定物种的绝对丰度在某种程度上是物种特异性qPCR检测结果的合理替代，尤其是当细菌以较高的相对丰度存在时。这种方法提供了一个机会来评估细菌物种的绝对丰度，而无需为每个特定物种开发单独的qPCR分析方法。

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Microbiome：哪些肠道细菌产生三甲胺？新方法准确鉴定！

重要的一项研究，也有方法学上的创新，推荐读一读。

三甲胺(TMA) 膳食季胺肠道菌群功能性诊断胆碱TMA-裂解酶(cutC)

SR：哪种PCR方法检测产肠毒素脆弱拟杆菌最靠谱？

选取19位结直肠癌患者体腔和粪菌的ETBF，比较四种检测毒素基因的方式：标准PCR、两种定量PCR和数字PCR，哪种方法最灵敏？作者推荐哪一种？这篇文章不妨看看。

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