Fátima C Pereira

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Fátima C Pereira

文章数：3篇

菌群分析方法

拉曼结合原位杂交实现单细胞水平菌群代谢分析

这是发表在PNAS上的一份工作，作者结合受激拉曼散射的优势进行单细胞稳定同位素探测以及双光子FISH，以高通量方式识别细胞，同时实现对胞内直径约为1µm的低浓度代谢物检测。该技术相较传统自发拉曼技术，具备通量高、成像速度快的优势。在原位跟踪人体肠道微生物的黏膜糖觅食相关行为时，作者发现黏膜糖代谢通常由拟杆菌门主导，但在岩藻糖代谢方面梭菌表现优于拟杆菌门。

菌群分析方法菌群代谢功能肠道菌群拉曼光谱单细胞水平

Nature子刊：助力研究“谁干了啥”的微生物细胞分选平台

本研究开发了一个基于拉曼光谱对来自微生物群落中的感兴趣的单个细胞进行自动分选的平台。这种细胞的分类及其下游DNA分析（例如通过微型宏基因组学或单细胞基因组学或培养）允许在复杂微生物群落中的微生物细胞的代谢作用和基因组之间建立直接联系，并有针对性地分离具有特定生理功能的新型微生物。作者预计，该方法将为特定环境和宿主相关微生物组研究提供多一种通用工具，以阐明微生物类群在其复杂群落中的代谢贡献。

拉曼光谱自动分选微流控技术单细胞基因组学微型宏基因组学

微生物生态学

Nature子刊：鉴定能减少致病菌定植的肠道共生菌

包括艰难梭菌在内的很多肠道致病菌，能用肠道黏液中的糖作为养料来生长。因此，使用占据同样生态位（利用黏蛋白单糖）的共生菌去挤占致病菌的生存空间，是潜在的微生态治疗策略。Nature Communications发表的一项最新研究报道了一种方法，在小鼠中鉴定出能利用黏蛋白单糖的多种共生菌，并从中挑选构建了混合菌株群落，能有效抑制艰难梭菌的生长和定植。该研究中使用的一些思路和方法，或能为研发新型益生菌/活菌疗法提供参考。

微生物生态学定植抵抗艰难梭菌益生菌