宏基因组工具

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宏基因组组装基因组（MAGs）

Nature Reviews：评估MAG质量的不同工具和策略（评论）

随着测序技术和生物信息学工具的快速发展，如今微生物相关研究已经产生了大量的宏基因组组装基因组（MAG），如何评估这些基因组的完整度和污染率，一直是该研究领域的重要课题。近日，发表在Nature Reviews Microbiology的一篇报道，介绍了用于评估微生物组研究中生成的MAG的质量的不同工具和策略（CheckM、CheckM2及uBin），为后续研究人员进行基因组质量评估提供了指导，值得关注。

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Nature子刊：一种快速、精确、稳健的宏基因组序列比较工具Skani

随着测序技术和生信工具的快速发展，如今的研究已经产生了数十万个MAG，基于数据库搜索这些MAG或计算所有成对相似性需要数十亿次比较，这对于传统的比对工具难度很大。近日，卡内基梅陇大学研究人员在Nature Methods发表最新研究，开发一种快速、精确、稳健的宏基因组序列比较工具Skani，实测性能较好，值得关注。

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