王军
中国科学院微生物研究所研究员、中国肠道大会联合发起人&执行主席
教授,中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师。2017年入选中组部“千人计划”青年项目。主要进行生物数据的深度挖掘和分析工作,工作中利用统计学和生物信息学结合的方法,研究肠道菌群在动物和人类生态、基因组进化和疾病中的作用。至今,在Science,Nature,Nature Genetics等国际一流科技刊物上发表SCI论文23篇,承担重大基金项目2项,申请专利1项。
揭秘S24-7科细菌
① 拟杆菌门S24-7菌科在肠道菌群中广泛存在,小鼠是最常见的宿主(平均相对丰度和共现菌种数为20%和9);② 用全长16S rRNA基因序列聚类推断出该科685个菌种,另用宏基因组学方法从小鼠肠道样本中重构了该科59个菌种的基因组草图,两者间有34个物种重叠;③ 分离培养出3个菌种的5个菌株,鉴定出2个新菌属;④ 基因组分析表明该科在功能和种系发生方面不同于相邻菌科,且在降解复杂碳水化合物上具有功能多样性;⑤ 建议命名该科为Muribaculaceae。
2019-02-19
Nature子刊:肠道菌群如何影响心理健康?
① 纳入1054名参与者,分析肠道菌群与抑郁以及生活质量的关系,得到的结果在另外1070名参与者中进行验证,证明肠道菌群与心理健康具有重要联系;② 产丁酸的粪杆菌属和粪球菌属,始终与较高的生活质量相关;③ 在排除抗抑郁药物的影响后,小杆菌属和粪球菌属在抑郁人群中呈现减少的趋势;④ 肠道细菌合成多巴胺代谢物——3,4-二羟苯酰乙酸的能力,与良好的心理健康状态呈正相关;⑤ 肠道细菌产生的γ-氨基丁酸,可能与抑郁状态有关。
2019-02-04
刘宏伟+刘双江:狄氏副拟杆菌改善小鼠肥胖和代谢障碍
① 在遗传和饮食诱导的两种肥胖小鼠模型中,口服狄氏副拟杆菌(PD)可改善代谢,控制体重、减少高血糖和脂肪肝;② PD可转化胆汁酸,增加次级胆汁酸石胆酸(LCA)和熊去氧胆酸(UDCA),还能产生琥珀酸;③ 补充LCA+UDCA可活化肠道FXR-FGF15通路、恢复肠道屏障完整性,从而缓解小鼠高血脂;④ 琥珀酸可结合果糖-1,6-二磷酸酶并增加其活性,从而促进肠道糖异生,补充琥珀酸可减轻小鼠高血糖;⑤ 补充琥珀酸+LCA+UDCA对肥胖小鼠的益处与补充PD相似。
2019-01-02
肾病末期患者的肠道菌群
① 慢性肾病(CKD)常伴随肠道菌群改变、菌群代谢物蓄积、肠道屏障功能破坏和慢性炎症;② 肾病末期患者的肠道菌群组成较为多变,未发现共性特征,尿毒症毒素如对甲酚偶联物(pC)、硫酸吲哚酚(IxS)、吲哚乙酸和肌酐的水平变化与菌群差异相关;③ IxS和pC水平与特定肠道菌呈反向相关性,pC高、IxS低的患者与pC低、IxS高的患者有显著不同的菌群,鉴定出6个菌属在这两类患者中有明显丰度差异;④ 以这些菌为靶点,或有助于改善CKD患者预后。
2018-11-21
对一种潜在二代益生菌的安全性评估
① 选取30名健康志愿者,进行一项随机双盲安慰剂对照交叉试验,评估产丁酸菌Butyricicoccus pullicaecorum 25-3作为潜在新一代益生菌的安全性;② 试验包括2阶段(每阶段4周)的干预期,受试者分别使用B. pullicaecorum 25-3或安慰剂,中间间隔3周清洗期;③ B. pullicaecorum 25-3干预期及安慰剂干预期中,受试者报告的不良事件数量相近,且该菌株并未破坏肠道菌群的组成及代谢活性;④ B. pullicaecorum 25-3在健康人中安全性及耐受性良好。
2018-11-06
中国科学院微生物所:全球化的微生物组数据存储和分析平台
① gcMeta建立了一个微生物基因组、转录组管理、分析、可视化及数据发布的一站式系统;② 存储了公共或私有的12万样本数据,总数据量超过120TB,并为用户提供项目数据管理系统;③ 平台基于Docker部署了90款生信软件,可实现(宏)基因组拼接和注释、扩增子和转录组分析等五大常用流程;④ 样本可提供发表专用的固定识别号(PID),并自动追踪引用;⑤ 平台是中科院中国微生物组计划成果的一部分,为世界提供了微生物组研究的“中国方案”。
2018-10-26
IBD患者的芽囊原虫携带率较低
① 收集616名健康人及107名IBD患者的粪便样本,分析芽囊原虫及其亚型、宿主相关参数、肠道细菌及古菌的多样性及组成之间的关联;② 30%的健康人肠道内存在芽囊原虫,而IBD患者的这一比例仅为4%;③ 宿主相关因素中,仅有年龄与携带的芽囊原虫亚型相关,而肠道菌群的群落组成则与芽囊原虫亚型有着很强的关联,④ 所有检测到的芽囊原虫亚型的流行率在以拟杆菌属为主的肠型样本中较低,芽囊原虫的亚型3及亚型4与Akk菌负相关。
2018-08-31
2020
Compositional and functional differences in human gut microbiome with respect to equol production and its association with blood lipid level: a cross-sectional study
Wei Zheng, Yue Ma, Ai Zhao, Tingchao He, Na Lyu, Ziqi Pan, Geqi Mao, Yan Liu, Jing Li, Peiyu Wang, Jun Wang*, Baoli Zhu* & Yumei Zhang*
Gut Pathog, 2020 May 10, 11, 20
2018
Meta-analysis of human genome-microbiome association studies: the MiBioGen consortium initiative
Jun Wang#, Alexander Kurilshikov, Djawad Radjabzadeh, Williams Turpin, Kenneth Croitoru, Marc Jan Bonder, Matthew A. Jackson, Carolina Medina-Gomez, Fabian Frost, Georg Homuth, Malte Rühlemann, David Hughes, Han-na Kim, MiBioGen Consortium Initiative, Tim D. Spector, Jordana T. Bell, Claire J. Steves, Nicolas Timpson, Andre Franke, Cisca Wijmenga, Katie Meyer, Tim Kacprowski, Lude Franke, Andrew D. Paterson, Jeroen Raes, Robert Kraaij, Alexandra Zhernakova
Microbiome, 2018 Jun 08, 6 (1), 101
Of Genes and Microbes: Solving the Intricacies in Host Genomes
Jun Wang#, Liang Chen, Na Zhao, Xizhan Xu, Yakun Xu, Baoli Zhu
PROTEIN CELL, 2018 Apr 02, 9 (5), 446-461
2016
Genome-wide association analysis identifies variation in vitamin D receptor and other host factors influencing the gut microbiota
Jun Wang*, Louise B. Thingholm*, Jurgita Skiecevičienė*, Philipp Rausch, Martin Kummen, Johannes R. Hov, Frauke Degenhardt, Femke-Anouska Heinsen, Malte C. Rühlemann, Silke Szymczak, Kristian Holm, Tönu Esko, Jun Sun, Mihaela Pricop-Jeckstadt, Samer Al-Dury, Pavol Bohov, Jörn Bethune, Felix Sommer, David Ellinghaus, Rolf K. Berge, Matthias Hübenthal, Manja Koch, Karin Schwarz, Gerald Rimbach, Patricia Hübbe, Wei-Hung Pan, Raheleh Sheibani-Tezerji, Robert Häsler, Philipp Rosenstiel, Mauro D’Amato
Nat Genet, 2016 Oct 10, 48 (11), 1396-1406
Population-level analysis of gut microbiome variation
Gwen Falony*, Marie Joossens*, Sara Vieira-Silva*, Jun Wang*, Youssef Darzi, Karoline Faust, Alexander Kurilshikov, Marc Jan Bonder, Mireia Valles-Colomer, Doris Vandeputte , Raul Y Tito, Samuel Chaffron, Leen Rymenans, Chloë Verspecht, Lise De Sutter, Gipsi Lima-Mendez, Kevin D'hoe, Karl Jonckheere, Daniel Homola, Roberto Garcia, Ettje F. Tigchelaar, Linda Eeckhaudt, Jingyuan Fu, Liesbet Henckaerts, Alexandra Zhernakova, Cisca Wijnenga, Jeroen Raes
Science, 2016 Apr 29, 352 (6285), 560-4
Lipocalin 2 protects from colonic inflammation and tumorigenesis through its microbiota modulating properties
Alexander R. Moschen*, Romana R. Gerner*, Jun Wang*, Victoria Klepsch, Timon E. Adolph, Simon J. Reider, Hubert Hackl, Alexandra Pfister, Johannes Schilling, Patrizia L. Moser, Sarah L. Kempster, Alexander Swidsinski, Dorothea Orth−Höller, Günter Weiss, John F. Baines, Arthur Kaser, Herbert Tilg
Cell Host Microbe, 2016 Apr 13, 19 (4), 455-69
2015
Analysis of intestinal microbiota in hybrid house mice reveals evolutionary divergence in a vertebrate hologenome
Jun Wang, Shirin Kalyan, Natalie Steck, Leslie M. Turner, Bettina Harr, Sven Künzel, Marie Vallier, Robert Häsler, Andre Franke, Hans-Heinrich Oberg, Saleh M. Ibrahim, Guntram A. Grassl, Dieter Kabelitz, John F. Baines
Nat Commun, 2015 Mar 04, 6, 6440
2014
Dietary history contributes to enterotype-like clustering and functional metagenomic content in the intestinal microbiome of wild mice
Jun Wang, Miriam Linnenbrink, Sven Künzel, Ricardo Fernandes, Marie-Josée Nadeau, Philip Rosenstiel, John F Baines
PNAS, 2014 May 27, 111 (26), E2703-10
2013
The role of biogeography in shaping diversity of the intestinal microbiota in house mice
Miriam Linnenbrink*, Jun Wang*, Emilie A Hardouin, Sven Künzel, Dirk Metzler, John F Baines
MOL ECOL, 2013 Feb 07, 22 (7), 1904-16
中国科学院微生物研究所研究员
中国肠道大会联合发起人&执行主席
教授,中国科学院微生物研究所研究员,博士生导师。2017年入选中组部“千人计划”青年项目。主要进行生物数据的深度挖掘和分析工作,工作中利用统计学和生物信息学结合的方法,研究肠道菌群在动物和人类生态、基因组进化和疾病中的作用。至今,在Science,Nature,Nature Genetics等国际一流科技刊物上发表SCI论文23篇,承担重大基金项目2项,申请专利1项。
2004-2008: 中国海洋大学生物技术专业,本科;
2008-2010: 比利时根特大学、西班牙奥维耶多大学、德国不来梅大学,联合硕士;
2010-2014: 德国普伦马普进化生物学研究所,博士。
2014-2017: 比利时鲁汶大学弗拉芒生物研究所,博士后;
2017.3-至今:中国科学院微生物研究所生物信息和计算生物学研究组组长。
主要利用统计学和生物信息学结合的方法,进行生物数据的深度挖掘和分析工作,涉及分子进化,数量遗传学,疾病的遗传学因素和环境因素,微生物生态和功能分析等。