John F Rawls

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John F Rawls

文章数：11篇

肠道微生物如何通过必需氨基酸与宿主互作？（综述）

近日发表在Annual Review of Microbiology上的综述总结了支链氨基酸（缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸）和色氨酸在宿主与肠道菌群间的互作方式，他们主要总结了微生物生产者从葡萄糖代谢产生三种支链氨基酸的具体途径，比较了目前支链氨基酸生产菌和消耗菌对宿主疾病发生发展的影响，包括胰岛素抵抗、肥胖、多囊卵巢综合征等，总结了色氨酸参与的犬尿氨酸途径、5-羟色胺途径和吲哚相关途径代谢通路，以及其如何串联宿主与肠道微生物。

HNF4A：整合菌群和脂质代谢信号的肠道关键转录因子

宿主肠道不断回应和适应复杂的食物和微生物环境因子，其转录整合策略和机制尚不清晰。Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology最新发表的文章采用无菌小鼠和悉生小鼠模型，给与单次高脂餐，进而通过多组学对肠道菌群和膳食脂肪两种因子对肠道上皮的调控进行了研究，鉴别出HNF4A这一关键核受体转录因子。

HNF4A 微生物和营养信号整合研究论文

Science子刊：斑马鱼肠道胆盐的FXR信号传导和微生物代谢

所有的脊椎动物都有胆盐的合成、分泌和再吸收过程。这一信号过程在哺乳动物中研究的较为深入，通常胆盐组成成分是由宿主和肠道微生物通过调节胆盐结合转录因子胆汁酸受体（Fxr）共同决定的。但是，目前对于其他脊椎动物类，该过程的情况仍知之甚少。近期一篇发表在Science Advances上的一篇研究工作，探索了脊椎动物模型斑马鱼肝脏胆盐合成和回肠转运的途径。研究显示在斑马鱼中，胆盐合成、分泌和再吸收的关键成分与哺乳动物是高度保守的，也同样受Fxr的调控。此外，研究利用单细胞测序技术，提供了斑马鱼肠上皮细胞图谱，揭示了Fxr在回肠其他细胞类型中的转录和细胞分化中的作用。这一研究成果建立了斑马鱼作为研究胆盐代谢和Fxr信号转导的非哺乳动物脊椎动物模型。

胆盐代谢胆汁酸受体 fxr突变体单细胞测序分析回肠上皮细胞功能特化

肠内分泌细胞

Cell子刊：肠内分泌细胞怎样感知肠菌信号并传给神经？

肠上皮利用上皮感觉肠内分泌细胞（EEC）感知营养和微生物刺激。脊椎动物的肠道受肠内神经系统（ENS）和来自自主神经的外源性神经元的支配，但肠道微生物刺激是否以及如何通过EEC调节ENS或迷走神经感觉活动尚不清楚。发表在Cell Host and Microbe上的一项研究发现了保守的TRPA1途径，通过这个途径，EEC可以调节肠道和迷走神经通路以响应微生物信号，或可用来治疗肠道菌群相关的神经系统疾病。

肠内分泌细胞色氨酸代谢产物共生菌-神经互作菌群-肠-脑肠蠕动

Nature Reviews：决定肠上皮细胞类型和对菌群反应的转录调控机制（综述）

肠上皮包含不同类型的细胞，并能对菌群等信号作出响应，这在一定程度上是取决于不同层面的基因转录调控。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology近期发表的重磅综述，主要从DNA甲基化、染色质可及性、组蛋白修饰和转录因子这4个层面，总结了参与肠上皮细胞特化和对菌群应答的转录调控机制，干货很多，值得专业人士参考。

肠上皮转录调控 DNA甲基化染色质景观组蛋白修饰

微生物组中心

Nature子刊：建立微生物组中心，为微生物组科学发声

Nature Microbiology最近发表的评论文章，从微生物组中心的任务及作用、出现的原因、面临的问题及解决方法等方面进行了阐述，意在说明微生物组中心的建立旨在共享战略和加速知识转移，为微生物组科学发声。

微生物组中心 Antonio Molinaro Ina Nemet Fredrik Bäckhed

“EECs沉默”-肠道内分泌细胞适应高脂饮食新机制

eLife发表的文章，采用转基因、高脂饲喂和悉生动物模型，揭示一种菌群介导的肠道内分泌细胞（EECs）对脂肪摄入适应的新机制，即“EECs沉默”。

高脂饮食肠道内分泌细胞（EECs) developmental biology infectious disease Microbiology

肠上皮细胞

Cell子刊：发育中的肠道如何吸收蛋白质

在肠道还未发育成熟时，饮食中的蛋白质是如何被吸收的尚未明确。Developmental Cell上发表的一项最新研究，发现在肠道中有一种特化的细胞——富含溶酶体的肠上皮细胞（LRE），通过内吞作用吸收蛋白质，对于发育中的斑马鱼及小鼠的存活及成熟至关重要。

肠上皮细胞 Cubilin Dab2 inter-organ transport Intestine

菌群-免疫互作

肠道血清淀粉样蛋白介导菌群进行免疫调控

《PLoS Pathogens》上发表的一项最新研究，报道了肠道中的血清淀粉样蛋白（SAA）——一种在菌群定殖后产生的免疫调节因子，可抑制中性粒细胞的异常活化。该结果对阐释菌群-免疫互作具有参考价值。

菌群-免疫互作血清淀粉样蛋白A 中性粒细胞 Duncan Sproul Roza H Ali Masalmeh

ISME：发育中的斑马鱼，肠道菌群条条都不同

① 在食物和环境均保持不变的情况下，斑马鱼发育过程中肠道菌群多样性呈下降趋势，并在35-75天之间最为显著；② 斑马鱼成鱼和幼鱼之间的细胞运动和碳水化合物代谢相关基因表达存在显著差异；③ 在遗传背景和生存环境相同的情况下，斑马鱼个体间的菌群组成仍呈现很大差异，并具有阶段特异性；④ 整个发育过程中肠道菌群聚集成不同的群落，个体间差异随年龄的增加而增加，且肠道菌群与周围环境菌群的差异也随之增加。

斑马鱼肠道菌群

ISME：微生态学，中性过程对菌群组装有何影响？

与人类相关菌群仍无法解释宿主间巨大差异。① 调查一定发育阶段斑马鱼肠道菌群并与中性预测模型对比组成和分布； ② 随着宿主发育模型拟合度下降，表明非中性过程相对重要；③ 观察菌群离开中性预测形成不同亚群；④ 表明中性过程足以产生菌群的宿主间差异且潜在类群或可由与中性分布差异确定。

斑马鱼肠道菌群生态学中性过程生态位过程