Manish Boolchandani

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Manish Boolchandani

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Nature子刊：腹泻对国际旅行者肠道菌群和耐药基因有何影响？

国际旅行可能会导致抗生素耐药性的全球传播，旅行者腹泻会进一步加剧感染耐多药类型微生物的风险，并可能导致旅行后持续的胃肠道疾病。然而，目前关于腹泻对旅行者肠道菌群和耐药基因动态传播有何影响仍知之甚少。近日，美国华盛顿大学研究人员在Nature Communications发表最新研究，纳入159名访问秘鲁库斯科城的国际学生，纵向收集718份（144份腹泻和574份非腹泻）粪便样本测序。相比无腹泻人群，腹泻患者的肠道菌群组成发生显著变化（但多样性相对稳定），抗生素耐药基因丰度更高，且致泻性大肠杆菌在耐药基因携带方面起关键作用。总之，该研究表明国际旅行者的肠道菌群对生态失调具有弹性，但他们也容易被耐多药细菌定植，这种风险在患有腹泻的旅行者中更为明显。

国际旅行耐药基因研究论文基础研究肠道菌群

抗生素抗性基因

旅行或可增加肠道菌群的抗生素耐药性

抗生素耐药性细菌及其抗生素抗性（AMR）基因可以通过搭便车在人类肠道中传播。国际旅行可能会加剧这种公共卫生威胁。之前的研究已经证明了旅行相关的特定条件致病菌和AMR基因的获取，但旅行对肠道AMR的影响程度尚不清楚。Genome Medicine发表的研究，提供了关于中低收入地区国际旅行对高收入国家旅行者肠道耐药性影响的新数据。研究发现，这些旅行者在国外获得了AMR基因，并将这些AMR基因带回了他们的原籍国。这些AMR基因既包括已知的临床相关且在病原体中常见的AMR基因，也包括在功能上发现的目前数据库中没有已知同源物的AMR基因。研究还表明，肠道中AMR基因的获取和携带与旅行地相关，并且其组成特征至少会持续到旅行者回家。本研究结果提示，在目前抗生素耐药性负担高流行的低收入和中等收入国家，采取干预措施减少抗生素耐药性负担，可能会减少旅行者的抗生素耐药性基因获取。

抗生素抗性基因旅行抗生素耐药菌肠道菌群

抗生素耐药性

华南农大团队：环境变化影响肠道菌群和耐药基因组成

人体胃肠道是一个开放的生态系统，可直接或间接从外部环境中（例如食物、水、土壤和动物）中获取微生物。但是，环境与人类肠道菌群之间微生物交换的程度和持续时间仍未得到很好的理解。养殖环境因富含大量的微生物，成为菌群和耐药基因交换研究的热点地区。华南农业大学刘雅红团队与合作者近期在Nature Communications发表研究发现，猪场的职业暴露会影响人的肠道微生物组，从而导致潜在动物病原菌和抗生素耐药基因在肠道内的富集。比较学生与猪场工人及猪场环境的宏基因组样本，发现在学生、工人和环境间普遍存在菌株和耐药基因交换。该研究揭示了生活环境的短暂变化是如何以及在多大程度上塑造了人类肠道菌群及其耐药性。

抗生素耐药性 Antimicrobial resistance metagenomics microbial ecology Microbiome

Nature Reviews：细菌耐药性的研究方法（综述）

作者系统阐述了基于测序的抗性基因发现、抗性基因数据库的建设、功能宏基因组学在抗性基因研究中的应用和通过机器学习预测抗性基因的方法，非常值得相关研究人员关注。

抗性基因宏基因组功能宏基因组机器学习基因组数据库