物种组成

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抗生素治疗

抗生素治疗期间补充益生菌或无法维持肠菌多样性？（荟萃分析）

益生菌常用于预防抗生素引起的低多样性生态失调，但其作用尚未得到充分总结。近日，匈牙利塞梅尔维斯大学研究人员在BMC Medicine发表最新研究，通过对随机对照试验进行系统回顾和荟萃分析，评估在抗生素治疗期间补充/不补充益生菌患者间肠菌多样性的差异，发现抗生素治疗期间补充益生菌或无法维持肠道菌群多样性。但本研究整体样本量较小，未来还需进一步的高质量研究验证，值得关注。

抗生素治疗益生菌荟萃分析基础研究肠道菌群

重庆医科大学开发兼顾原核生物和病毒的宏基因组物种组成分析软件KMCP

本研究开发了一款新的宏基因组物种组成分析软件KMCP，它使用改进的COBS（紧凑的位分片签名索引）数据结构来对微生物参考基因组进行索引，并结合k-mer相似性与基因组覆盖信息来提高宏基因组物种组成分析的准确性。KMCP数据库构建的高效性和序列搜索的可扩展性使得KMCP能有效的利用日益增多的参考基因组。KMCP由Go语言实现，提供Linux、Windows、macOS操作系统的amd64和arm64架构的静态链接可执行程序，用户只需要下载解压，开箱即用，也可通过conda安装。

原核生物病毒宏基因组物种组成 k-mer