微生物溯源

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文章数：3篇

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家庭环境和动物粪便污染影响婴幼儿肠道微生物组和耐药基因组

生命早期是人类肠道菌群发育和随后健康的关键窗口期，虽然分娩方式、喂养方式和抗生素使用等可以塑造肠道菌群，但家庭环境的作用仍不清楚。此外，在水源污染和卫生基础设施较少的环境中，肠道抗菌剂耐药性在健康和疾病中的作用还未知。近期发表于Microbiome上的文章，调查了尼加拉瓜农村婴幼儿的肠道微生物组和耐药基因组，研究了肠道菌群多样性和抗生素耐药基因丰度的差异与宿主和家庭环境因素的关系。结果表明，宿主年龄、肠道菌群多样性和抗药性存在显著关联。

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用SNV进行更准确的微生物源追踪

这是发表在Genome Biology上的一份工作，作者将SNV作为FEAST的输入文件以提高其准确度和计算效率，同时为了克服计算负担，开发了一种新的标签SNV鉴定方法。通过三个独立的数据集验证了该方法的准确性和鉴定评估了环境样本对目标样本的贡献度，比物种丰度信息作为输入更准确地估计贡献并提供新的见解。

微生物溯源方法技术

iMeta：扬州大学团队揭示同域内同食物的两种昆虫肠道微生物群落装配机制

本文研究了同域内取食相同食物（杨梅）的两种野生昆虫，即拟果蝇和黄粉鹿角花金龟的肠道细菌和真菌群落的装配过程和潜在来源。作者研究发现两者肠道菌群的多样性、组成和网络结构存在显著差异，该研究揭示了同域内的昆虫肠道菌群结构和功能的形成过程中，群落装配过程比区域物种库发挥更加重要的作用。

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