杨展

噬菌体抗菌耐药性 Joep Beumer Helmuth Gehart

与口腔菌群为友，就是要通过合理的饮食、良好的生活习惯等维护口腔菌群与人的和谐共存关系。

口腔菌群 Caries Dysbiosis human oral microbiology microbial ecology

Scientific Reports近期发表了来自中国人民解放军总医院杨云生团队主导的研究，鉴定出胃息肉患者的胃粘膜菌群与健康人之间的差异，并在菌属水平建立了可区分患者和健康个体的预测模型。该研究表明，胃菌群失调可能与胃息肉有密切关系，值得专业人士关注。

胃息肉胃息肉胃菌群幽门螺杆菌 Gautam Dantas

肥胖

肥胖粪便盐度 AKK菌 Judith Aron-Wisnewsky Karine Clément

菌群可塑性

深入雨林如何影响城市人的菌群

mSphere近期发表一项有意思的小型人体研究，让7名城市志愿者进入热带雨林村庄，并按当地生活和饮食方式居住一段时间，后续分析表明，儿童的菌群可塑性优于成年人，成年人的菌群相对稳定。

菌群可塑性 Amerindian Diet Microbiome 饮食

免疫

探讨菌群和免疫性别差异的关联性和因果关系

一般来说，女性的先天免疫反应和适应性免疫反应都比男性更强。这种性别差异同样在肠道菌群中存在。鉴于肠道菌群在免疫系统发育等方面的重要作用，有必要深入探讨菌群和免疫的性别差异之间的关联性。Frontier in Immunology上的这篇小综述探讨了目前的进展和对未来的展望。

免疫两性差异 Roberto Pacifici Jau-Yi Li

杀虫剂耐受性

昆虫的杀虫剂耐受性可能由肠道菌群介导

昆虫对杀虫剂的耐受性可能与肠道菌群有关。《Frontiers in Microbiology》近期发表研究，发现不同肠道细菌对小菜蛾的杀虫剂耐受性影响不同，而且该影响可能与小菜蛾抗菌肽产生能力有关，提示肠道菌群对小菜蛾耐受性的影响机制可能涉及菌群-免疫系统互作。

杀虫剂耐受性动物菌群 Diamondback moth gut bacteria Immunity

牙周病

周集中团队：不同牙周健康状态下的口腔菌群

这是 ISME Journal[IF：9.664]发表的一篇重要的口腔菌群研究，关注不同牙周健康状态下的口腔菌群变化，由俄克拉荷马大学的周集中教授领衔，非常值得关注，特别推荐。

牙周病唾液菌群牙菌斑口腔菌群 Poghni Allen Peri-Okonny

孢子

MER：如何在空气样本中检测真菌

这是Molecular Ecology Resources[IF：7.332]发表的一项方法学研究，介绍了通过一种气旋式取样器收集空气样本以做真菌研究和坚定的方法。值得参考学习，特别推荐。

孢子真菌空气 Atmospheric diversity Fungal diversity

饮用水

WR：不同饮用水造成小鼠肠道菌群各异

这是Water Research[IF：6.942]发表的一项值得重点关注的研究，发现四种不同类型的饮用水对小鼠的肠道菌群有不同影响。这具有很大的启发和指导意义，或许未来我们可以看到志愿者身上的人群研究。特别推荐。

饮用水 Erin S LeBlanc Erin S LeBlanc

细胞衰老

Nature Reviews：细胞衰老在胃肠和肝脏疾病中的“双刃剑”效应（综述）

细胞衰老是机体细胞应对多种刺激因素的反应机制。本综述系统性回顾了细胞衰老及其在胃肠道和肝脏病变中的作用，强调了细胞衰老相关的分泌表型对肿瘤产生存在抑制和促进双重效应，指出了细胞衰老过程及相关的细胞分泌表型变化有望作为癌症治疗新靶标，值得专业人士参考。

细胞衰老胃肠道疾病肿瘤细胞衰老相关分泌表型

鸡

FM：鸡的肠道菌群是怎样建立起来的？

这是上海交通大学农业与生物学院团队针对鸡的肠道菌群建立进程所做的研究，值得关注，特别推荐。

鸡

阴道菌群

FM：人类阴道菌群独特性的成因或很复杂！

这是对之前的文献分析研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1050455844）所做的评论，针对之前的研究者提出的“高水平的淀粉摄入造成阴道中的糖原水平增加，促进乳酸杆菌的增殖”的假设，提出自己的看法——激素、饮食、生活习惯等等复杂的因素都可能影响阴道菌群，为此不能简单化归结于一种原因。两篇文章连起来看，必有收获。

阴道菌群乳酸杆菌 Sean F Brady Aleksandr Milshteyn Dominic A Colosimo

神经退行性疾病

CON：菌群与神经退行性疾病（综述）

一篇系统性总结肠道菌群与阿尔兹海默症、帕金森病等疾病相关性的综述，内容详尽，值得关注。

神经退行性疾病

干细胞移植

Nature子刊：做造血干细胞移植，请注意肠道病毒的影响

这是对同期发表的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1050454788）的简要介绍，老规矩，看看图就会有收获。

干细胞移植移植物抗宿主病病毒组

蝙蝠

SR：在蝙蝠中发现新的哺乳动物病毒

第三军医大学和南京军区医学研究所团队针对蝙蝠携带的病毒的研究，发现了新的哺乳动物病毒，很值得关注，特别推荐。

蝙蝠病毒组 David John Lynn Miriam Anne Lynn Damon John Tumes

肠道病毒组

APT：一文读懂肠道病毒组（综述）

近期关于肠道病毒组的一篇必读综述，推荐感兴趣的专业人士精读。

肠道病毒组肠道噬菌体

慈鲷鱼

ISME：利用肠道菌群，可预测鱼的饮食习惯

这是一项在鱼身上做的肠道菌群如何受到食物的影响而产生趋同进化的研究，在鱼这个很好的模型上，明确了可以通过肠道菌群确认和预测饮食习惯，这对其他动物模型乃至人的研究具有启发意义。结合之前在Cell上发表的非常火热的个体化营养的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1053870848）来阅读，必有收获。

慈鲷鱼适应辐射趋同进化 Bas Oldenburg Joren R Ten Hove

弯曲杆菌

EM：南非的海鸥，或传播病原菌和耐药基因！

这是一项在南非开展的研究，发现天上飞的海鸥，像地上走的和被人吃的其他动物一样，可能是病原菌和耐药基因传播的有效宿主。有趣并也是值得关注的研究，特别推荐！

弯曲杆菌沙门氏菌海鸥耐药性 PFGE

耐药菌

FEE：生态学有助于研究肉用动物耐药基因传播（综述）

对大部分人来说，鸡、牛、猪、羊、鱼等肉用动物不可缺少，但现代养殖业中使用大量抗生素，其促进增加的耐药性基因会随着肉食进入人体。研究耐药基因的传播过程很重要，这篇综述系统总结了生态学的理论在相关研究中的应用，很值得一读。

耐药菌食用动物生态学

牛奶菌群

Microbiome：不使用抗生素，牛奶菌群也可在感染后自行恢复

奶牛的乳腺炎，是农业养殖中备受关注的疾病，目前在美国常规的方法是使用抗生素头孢噻呋。这项研究发现感染大肠杆菌后的牛奶菌群显著改变，但不管是否使用抗生素，最后都会恢复。很值得关注，特别推荐！

牛奶菌群乳腺炎头孢噻呋大肠杆菌 Milk microbiome

醋

COB：谷物发酵成醋，哪些细菌起作用？（综述）

这是江南大学团队关于利用谷物进行醋发酵过程中存在什么菌株以及它们有何功能的综述，系统性阐述了相关研究方法以及现有的认识。很值得工业界人士好好阅读，绝对涨知识。

醋发酵

食物残渣

BT：利用微生物发酵，将食物残渣变成良好化肥（综述）

这篇综述无关于肠道菌群，但特别关注了针对食物残渣的更科学更有效的可持续利用，很值得阅读，特别推荐。

食物残渣温室气体堆肥化 Composting Food waste

皮肤疾病

CPT：皮肤菌群与疾病

这是一篇Editorial，不过内容还是详实，对皮肤菌群和相关疾病的介绍很深入，建议可以当Review读，特别推荐！

皮肤疾病药物作用皮肤微生物组 Daniel Garrido Pamela Thomson

数据共享

Lancet：临床试验数据共享的时代即将到来？

《Lancet》近期发表申明，阐述了国际医学期刊编辑委员（ICMJE）会对发表在ICMJE下属杂志中的临床研究的数据共享规定，指出临床试验数据共享规范化的科研规范趋势，对于今后的临床研究具有指导作用。

数据共享临床试验研究国际医学期刊委员会数据共享临床研究

利福昔明

JGH：利福昔明可缓解肠易激综合征且与肠道菌群无关

① 利福昔明是治疗肠易激综合征（IBS）的有效药物，但其作用机理并不完全清楚，有研究者认为其可能与肠道菌群有关，但也有很多研究证据不支持这个结论；② 利用PI-IBS小鼠模型研究发现，利福昔明可以降低内脏敏感性，修复肠道屏障功能，抑制结肠和回肠的炎症反应，促进主要TJ蛋白——闭合蛋白的表达；③ 最重要的发现是，利福昔明发挥这些有益的功效的同时，对肠道菌群的组成和多样性几乎没有影响，包括乳酸杆菌和双歧杆菌的含量。

利福昔明抗炎症作用肠屏障功能肠易激综合征 Rifaximin

噬菌体

Microbiome：厌氧分解过程中的噬菌体-原核生物动态变化及互作

清华大学环境学院团队的工作，特别推荐。

噬菌体原核生物污水处理厌氧分解

肠道干细胞

FI：肠道干细胞与肠道菌群的关联（综述）

难得的肠道干细胞与肠道菌群关联性的综述，特别推荐。

肠道干细胞

大闸蟹

FM：大闸蟹生病，体内菌群发生变化

还有几个月才到吃大闸蟹的最好时间，不过关于大闸蟹的菌群研究，大家可以先享用[呲牙]

大闸蟹宏转录组肝胰腺坏死疾病