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Qiuwen He
文章数:9篇
肠道菌群
张和平+孙志宏Nature子刊:内蒙古人肠道菌群高质量基因组集合
近年来,基于非培养策略下的宏基因组学分箱技术,为各种自然生态位中大量尚未被培养的微生物提供了参考基因组,也让我们有机会对这些“暗物质”有基本的认识。然而,当下参差不齐的基因组质量和非典型地区人群样本的缺乏限制了我们对暗物质更深入的理解。近日,内蒙古农业大学张和平和孙志宏与团队在Nature Microbiology发表最新研究,基于先前开展的一项益生菌(Probio-M8)酸奶人群干预试验,利用PromethION和HiSeq平台对其中180份粪便样本进行超深度宏基因组测序,通过分析宏基因组中还原出的Probio-M8基因组对组装流程进行了验证,随后基于分箱策略构建了内蒙古人肠道基因组数据集(IMGG)。IMGG显著提升了基因组元素的分辨率,包括核糖体RNA操纵子(rrn)、代谢基因簇、前噬菌体和插入序列(IS)。特别地,该研究还报道了超400种未培养物种的rrn拷贝数,超12000个未知肠道前噬菌体及其功能特征,以及IS元素在肠道细菌中的分布情况。总的来说,这项研究拉近了我们与“白金”基因组的距离,也提示未来肠道基因组学研究需要重点关注代表性不足的基因组区域。
肠道菌群
宏基因组组装基因组 (MAG)
后生元
孙志宏等:后生元或许更有助于调节小鼠结肠炎
2021年5月,ISAPP发布了后生元共识声明,促使后生元成为全球肠道微生态领域备受关注的品类,业界更是响起“后生元将会继益生菌之后成为撬动大健康产业的一根有力杠杆”的呼声。目前,很少有研究直接比较后生元和益生菌的治疗效果。近期内蒙古农业大学孙志宏研究团队在npj Science of Food上发表了关于后生元的初探成果,他们发现,益生菌和后生元均可以改善小鼠溃疡性结肠炎症状,然而后生元似乎比益生菌具有更强的调节肠道菌群及其代谢通路能力,未来还需要更详细的去探究其潜在机制。
后生元
结肠炎
研究论文
基础研究
肠道菌群
益生菌
张和平团队:干酪乳杆菌Zhang通过调节肠道菌群,抑制GLUT1敲除小鼠的肥胖
内蒙古农业大学的张和平团队在European Journal of Nutrition上发表的一项最新研究结果,发现葡萄糖转运蛋白1(GLUT1)的肠道特异性敲除可通过影响肠道菌群、脂肪累积及糖耐量,以诱导小鼠肥胖;而补充干酪乳杆菌Zhang可通过调节肠道菌群及减少脂肪累积,以缓解GLUT1敲除引起的小鼠肥胖。
益生菌
干酪乳杆菌Zhang
肥胖
研究论文
基础研究
母婴菌群
张和平团队:胎粪菌群或主要源于羊水菌群
内蒙古农业大学张和平团队在Gut Microbes上发表文章,通过分析39对母婴的首次胎粪和母体样本(羊水、粪便、阴道液体和唾液) 微生物群探讨新生儿胎粪微生物群的母体来源,发现胎粪微生物来自多个部位,但主要来源于羊水菌群。
母婴菌群
Meconium
amniotic fluid
vaginal fluid
In utero colonization
干酪乳杆菌Zhang
长期摄入干酪乳杆菌Zhang,或可稳定成人菌群、缓解老年菌群衰老
关于长期摄入益生菌对年龄特异性的肠道菌群变化影响的研究较少,Journal of Functional Foods最近发表了内蒙古农业大学团队与马来西亚理科大学团队的合作研究,该研究招募了40名志愿者,分为成人-安慰剂组、成人-益生菌组、老年人-安慰剂组和老年人-益生菌组,分别接受干酪乳杆菌Zang(LcZ)或安慰剂干预12个月,结果表明,LcZ长期干预或能调节肠道菌群结构,并且这种调节作用具有年龄依赖性。
干酪乳杆菌Zhang
成人
老年人
衰老
以人为对象的临床试验
干酪乳杆菌Zhang
长期摄入干酪乳杆菌Zhang,或可稳定成人菌群、缓解老年菌群衰老
关于长期摄入益生菌对年龄特异性的肠道菌群变化影响的研究较少,Journal of Functional Foods最近发表了内蒙古农业大学团队与马来西亚理科大学团队的合作研究,该研究招募了40名志愿者,分为成人-安慰剂组、成人-益生菌组、老年人-安慰剂组和老年人-益生菌组,分别接受干酪乳杆菌Zang(LcZ)或安慰剂干预12个月,结果表明,LcZ长期干预或能调节肠道菌群结构,并且这种调节作用具有年龄依赖性。
干酪乳杆菌Zhang
益生菌
Lactobacillus casei Zhang
Gut microbiota
Random Forest algorithm
Lactobacillus plantarum P-8
张和平等:植物乳杆菌P-8在宿主体内的基因组变异
来自内蒙古农业大学的张和平团队的最新研究,分析了益生菌菌株——植物乳杆菌P-8在宿主体内的基因组存留及基因组稳定性情况。在肠道环境下,植物乳杆菌P-8丢失了一些质粒,并可能获得了一些其它物种的遗传信息。
Lactobacillus plantarum P-8
植物乳杆菌P-8
研究论文
临床对照实验
肠道菌群【有显著改善】
植物乳杆菌P-8
张和平等:植物乳杆菌P-8在宿主体内的基因组变异
来自内蒙古农业大学的张和平团队的最新研究,分析了益生菌菌株——植物乳杆菌P-8在宿主体内的基因组存留及基因组稳定性情况。在肠道环境下,植物乳杆菌P-8丢失了一些质粒,并可能获得了一些其它物种的遗传信息。
植物乳杆菌P-8
乳铁蛋白
JFF:乳铁蛋白的免疫调节功能依赖于完整的肠道菌群
这是关于乳铁蛋白如何与肠道菌群互作并影响肠道免疫功能的大鼠研究,值得特别关注。
乳铁蛋白
免疫调节
lactoferrin
Immunomodulation
Gut microbiota