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菌群-疾病关联性
文章数:10篇
帕金森病(PD)
预防帕金森病,保持肠道健康很重要(综述)
炎症性肠病(IBD)是一种引起胃肠道或肠道炎症的慢性疾病,因为免疫系统攻击肠道中的健康组织细胞和生活在那里的有益细菌。既往的研究已经提出,肠道炎症会影响帕金森病(PD)的发展。肠道功能障碍可能是帕金森病早期症状,甚至是先于帕金森病并导致其发生的元凶。确定与帕金森病前驱阶段有关的风险因素或有助于进行疾病早期干预研究,这可能会改变或减缓疾病进展。发表在Gut上的一篇综述文章,详细比较了这两种疾病的异同,指出它们可能具有相同的遗传学特征和可能的生物学联系。该文章强调了通过调节和改善肠道功能来预防和缓解PD疾病的重要性。
帕金森病(PD)
炎症性肠病
菌群-疾病关联性
富亮氨酸重复激酶2
肠-脑轴
肠道菌群
薛丽香+徐立+蔡军:肠道菌群与心血管疾病(综述)
肠道菌群组成、特异性菌种或菌群的变化与各类疾病的发生有密切的相关性。最近的研究表明,心血管疾病(Cardiovascular disease,CVD)也可能与肠道菌群失衡有关。北京大学第三医院的薛丽香、首都医科大学附属北京朝阳医院的徐立和阜外医院蔡军等人发表在Protein & Cell上的一篇综述文章,系统阐述了肠道菌群失调与高血压、动脉粥样硬化和心力衰竭等CVD的相关性以及对CVD的发生和发展的潜在影响,并指出调控肠道菌群有望作为心血管疾病的潜在治疗新靶点。
肠道菌群
心血管疾病
action mechanism
cardiovascular diseases
Gut microbiota
呼吸道感染
Cell子刊:生命早期菌群与呼吸道感染(综述)
呼吸道感染(respiratory tract infections,RTI)是导致全世界儿童较高发病率和死亡率的主要原因之一。这些感染范围从轻度上呼吸道感染或普通感冒到危及生命的疾病,包括下呼吸道感染(LRTI)或肺炎。通常认为RTI是由病毒或致病菌如流感嗜血杆菌和肺炎链球菌引起,但一些无症状感染现象表明这种观点似乎不够准确。研究表明,呼吸道和肠道菌群与RTI的发病机制有着明显的联系。宿主和环境因素可以在生命早期驱动呼吸道菌群的成熟,这反过来又与对RTI的连续易感性有关。此外,在RTI(包括病毒性细支气管炎)期间,局部微生物似乎通过复杂的相互作用发挥免疫调节作用,尽管这些因果关系尚未完全证实。发表在Cell Host & Microbe的一篇综述探讨了支持这些联系的流行病学证据以及内在机制。对生命早期呼吸道感染的长期后果和菌群在RTI发病各阶段的综合作用的理解有助于早期预防和干预治疗,以促进呼吸道健康。
呼吸道感染
respiratory microbiota
respiratory tract infections
RTI susceptibility
Host-Microbiota Interactions
菌群-疾病关联性
年龄可能影响对疾病相关菌群特征的鉴别
对疾病、菌群与年龄三者之间关联的研究较少。来自eLife上发表的一项最新研究,发现随着年龄的增长,个体将逐渐获得与疾病相关的菌群特征,并鉴定出一个与年龄增长相关的分类群集合,该集合的变化在多种疾病中均可发现。该研究结果提示,年龄相关的菌群变化可能影响对菌群-疾病关联的研究。
菌群-疾病关联性
年龄
菌群数据库
哈尔滨医科大学:gutMDisorder——疾病和干预与肠道菌群关联性的数据库资源
为了方便科研人员了解在疾病和干预中的肠道菌群失调,哈尔滨医科大学团队开发了gutMDisorder数据库,汇总了在人类和小鼠中证实的肠道微生物与疾病或干预之间的关联性信息,并为用户提供下载和检索等功能,相关成果近期在Nucleic Acids Research发表,值得专业人士关注。
菌群数据库
人肠道菌群
小鼠肠道菌群
菌群-疾病关联性
菌群-干预关联性
宏基因组分析工具
分析菌群与疾病关联的新工具MicroPro
近年来不少研究着眼于分析疾病相关菌群特征(特别是标志性类群的丰度)来预测疾病状态,Genome Biology近期发布了一个新的宏基因组学分析工具——MicroPro,可同时纳入已知和未知的微生物进行分析。MicroPro比基于参考序列的分析方法有更好的疾病预测准确性,比基于de novo组装的方法所需的计算成本更低,可谓是结合了两种分析方法的优点。
宏基因组分析工具
菌群-疾病关联性
病毒
特发性肺纤维化
特发性肺纤维化与呼吸道菌群的因果关系(评论)
研究表明,环境和宿主之间的相互作用在特发性肺纤维化(IPF)的发生和发展中起到一定的作用,特别是微生物感染因素在IPF发病与进展中具有重要的意义。呼吸道菌群失调与IPF密切相关,但关联性并不等于因果性。发表在American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine上的一篇评论文章指出,对于呼吸道菌群和IPF因果性的研究充满了挑战。尽管小鼠模型的研究表明,呼吸道菌群失衡通过促进宿主炎症加剧IPF进程,但由于博莱霉素诱导的IPF小鼠模型难以体现真实疾病状态,并且由于人类IPF疾病研究的局限性,因此需要更多的临床证据来证实人类呼吸道菌群与IPF的因果关系,从而为个性化治疗提供理论指导。
特发性肺纤维化
IPF
Microbiome
bleomycin
因果关系
代谢疾病
Nature子刊:肠道菌群、短链脂肪酸和代谢疾病有因果关联
肠道菌群与2型糖尿病、肥胖等代谢异常具有相关性。Nature Genetics近期发表的一份通信研究,通过结合全基因组基因分型、肠道宏基因组和代谢产物数据,利用双向孟德尔随机化法分析,发现肠道菌群和特定代谢产物与人体代谢具有因果关系。该方法和结果对菌群-疾病相关研究具有重要参考价值。
代谢疾病
肠道菌群
肠道菌群代谢物
孟德尔随机化法
代谢疾病
生物信息学工具
更可靠的定位疾病相关物种类群
传统上,如果需要得到最低分类级别上物种类群,通常直接在对应分类级别上进行关联分析。这忽视了微生物之间在演化上存在的固有联系。massMap 通过整合分类树,分两步定位关键物种,优化了相应的分析结果。
生物信息学工具
菌群-疾病关联性
分类树
进化树
Alexei Verkhratsky
菌群-疾病关联性
Nature子刊:肠道菌群与常见疾病和药物的大规模相关性研究
Nature Communications本周上线一项可能是迄今最大规模的肠道菌群与常见疾病和药物的关联性研究,不仅鉴定出许多新关联,还表明某些菌群标志物可用于反映整体健康情况,而非特定疾病。这些发现为未来肠道菌群与人体健康的研究提供了大量宝贵的数据参考,值得特别关注。
菌群-疾病关联性
菌群-药物关联性
肠道菌群
英国TwinsUK队列
Mustafa Raoof