肠道菌群

肠道微生物组的变化可能参与了肠易激综合征（IBS）的发生发展，但背后的机制仍待深入挖掘。Cell最新发表了来自美国梅奥诊所Purna Kashyap团队与明尼苏达大学Dan Knights团队的研究，通过纵向取样的整合多组学方法，揭示了IBS及其不同亚型（便秘型、腹泻型）的肠道菌群组成和功能（代谢产物、基因）的变化特征，以及这些变化可能参与IBS发病的机制，相关的菌群代谢物和宿主-微生物代谢途径或是潜在的IBS治疗靶点。该研究是通过纵向多组学方法研究人类疾病机制的一个范例。

肠易激综合征 physiology functional bowel disorders Diet symptom severity

脂肪肝

早期营养不良或导致脂肪肝和异常肠道菌群

非酒精性脂肪肝（NAFLD）常发生在营养过剩的人群，但在营养不良人群也有发生。营养不良会破坏全身代谢，并与肠道微生物失调有关。事实上，在卫生条件差的地区，长期接触粪便微生物会导致营养不良。mSystems近期发表的文章，发现营养缺乏可导致早期生命发育的一个重要窗口中断，会显著影响肝功能，饮食干预可减轻营养不良小鼠的异常代谢和菌群特征。

脂肪肝 gut-liver axis metabolomics Microbiome NAFLD

几丁质-葡聚糖

几丁质‑葡聚糖与肠道菌群的互作

膳食纤维与肠道菌群的互作在很大程度上促进其生理效应，几丁质-葡聚糖（CG）可改善小鼠的肥胖相关的代谢紊乱，但其对人体肠道微生物群的影响尚未评估。Gut Microbes近期发表的文章，招募15名健康志愿者进行3周的CG补充研究，发现CG的耐受性良好，诱导肠道菌群发生特异性变化，并增加粪便中细菌代谢产物，揭示出几丁质-葡聚糖与肠道菌群之间的相互作用。

几丁质-葡聚糖 Gut microbiota chitin-glucan fiber SCFA

急性髓系白血病（AML）

加强肠道屏障，改善白血病患者化疗预后

诱导化疗（7 + 3方案）仍是治疗急性髓系白血病（AML）的金标准，但会引起肠道损伤，并导致血行感染（BSI）等多种并发症。最新发表在Gut Microbes的研究通过评估急性髓系白血病（AML）患者诱导化疗（7 + 3方案）前、中、后的微生物群组成，并使用转基因Tg222 AML小鼠模型模拟AML患者，评估小鼠化疗前后肠道菌群组成，发现加强肠道屏障是限制BSI和改善AML患者预后的潜在策略。

急性髓系白血病（AML）肠道菌群诱导化疗肠道屏障

代谢疾病

一文+一图读懂：肠道菌群在人体代谢健康中的重要作用（重磅综述）

Nature Reviews Microbiology近期发表了来自丹麦哥本哈根大学Oluf Pedersen团队的一篇重磅综述，总结了与多种常见代谢疾病相关的肠道菌群变化特征，以及菌群代谢和衍生物参与驱动疾病发生发展的可能机制，并探讨了以菌群为导向的干预方法和未来的研究转化方向等内容。我们特别将文章中的图片编译为一图读懂，希望能帮助你涨知识。

代谢疾病肠道菌群饮食-菌群-宿主互作肠道菌群代谢产物

1型糖尿病

1型糖尿病患者的肠道菌群和血液代谢物，及其与蛋白尿的关系

Diabetologia近期发表的文章，通过对161名I型糖尿病和50名健康对照进行研究，证明长期的1型糖尿病患者的肠道菌群和血浆代谢物具有异常特征，且患有糖尿病肾病初期的I型糖尿病患者的肠道菌群和血浆代谢物水平与蛋白尿水平有关。

1型糖尿病肠道菌群血浆代谢物

慢性肾病

国内团队：慢性肾病患者的肠道菌群变化

浙江大学医学院附属第一医院的李兰娟院士团队与郑州大学附属第一医院的余祖江团队、刘章锁团队及吴歌在Advanced Science上发表的一项队列研究，对比分析了110名慢性肾病患者及210名健康对照的肠道菌群，鉴定出了患者的菌群多样性、组成及功能的变化，并利用5个OTU作为非侵入性标志物很好地区分了患者与对照。

慢性肾病研究论文生物标志物队列研究肠道菌群

急性胰腺炎

西式饮食恶化坏死性胰腺炎，哪种菌群疗法最合适？

肠道菌群是坏死性胰腺炎中的主要感染源，Gut发表的一项新研究中，荷兰阿姆斯特丹大学的研究者在小鼠模型中探究了饮食-菌群互作在急性坏死性胰腺炎（ANP）中的作用，发现高脂低纤维的西式饮食（WD）喂养会明显恶化小鼠ANP，与WD饮食导致的肠道菌群失调有关，补充这些小鼠缺失的菌群产物丁酸可有效改善病情，采用抗生素治疗也有一定效果，但意外的是，粪菌移植治疗反倒使病情恶化。这些结果说明丁酸在ANP发生发展中或有核心作用，及时补充丁酸或能防止急性胰腺炎恶化，也提示粪菌移植对特定疾病可能具有风险。

急性胰腺炎肠道菌群肠道菌群代谢产物丁酸后生元

心理压力

孕期心理压力或影响后代肠道菌群

本研究通过队列研究数据，通过量表评估结合头发皮质醇测定的方式，测评孕期母亲心理压力状态。并发现其与后代婴儿肠道菌群存在关联。由于肠道菌群对健康发育可能具有长期效应，将来的研究可以探索孕期心理压力是否通过影响婴儿肠道菌群改变从而引起健康损害。

心理压力队列研究孕妇肠道菌群皮质醇

铅暴露

环境铅暴露影响儿童肠道微生物组

该队列研究检测了婴儿的肠道细菌及微生物组构成，并将其与铅暴露水平进行关联分析。铅暴露影响婴儿的神经系统发育，而肠道菌群与神经系统发育也存在密切关联。本研究提示，铅暴露或可通过影响肠道菌群进而影响儿童发育。相关的机制有待进一步探索验证。

铅暴露研究论文医学研究婴儿肠道菌群

肠神经系统

Science：菌群如何通过肠神经来调控血糖？

肠神经系统血糖调控神经回路肠道菌群

乳制品

乳制品对肠道菌群的影响（综述）

目前，关于膳食对菌群的影响研究如火如荼，但是乳制品对肠道菌群的影响似乎还并不明确。本文结合现有的文献分析发现，一些乳制品可能可以增加有益菌（乳酸杆菌和双歧杆菌）的丰度，抑制有害菌的增殖，或者改善肠道环境，从而影响肠道菌群，进而影响人体健康。但是，一些乳制品衍生物，比如乳清和酪蛋白等对肠道菌群的影响甚微。文章认为，现有的研究有限，乳制品及其衍生品对肠道菌群的影响需要进一步研究明确。

乳制品肠道菌群 Gut microbiota dairy Inflammation

Eubacterium

真杆菌属细菌与人类健康（综述）

在过去的二十年里，我们对肠道菌群及其对健康和疾病的贡献的理解已经发生了转变。在已经被认可的潜在有益微生物的新成员中，有真杆菌属（Eubacterium）的成员，它们构成了人类肠道核心菌群的一部分。发表在Gut Microbes上的一篇综述文章对真杆菌属（Eubacterium），从系统发育的角度概述了真杆菌属细菌的种类，描述了它们如何随着饮食和年龄而改变，并总结了它们与人类肠道和各种健康状况的关系。

Eubacterium 肠道菌群 Gut microbiota short-chain fatty acids Eubacterium hallii

肠道菌群

华中农大：肠道菌群或影响狂犬疫苗效果

华中农业大学赵凌团队近期发表在Clinical and Translational Medicine上的文章，利用抗生素破坏肠道菌群平衡，降低狂犬疫苗诱导的体液免疫，且肠道菌群中梭菌目和毛螺菌科细菌丰度和狂犬病毒中和抗体的滴度成正相关，揭示出肠道菌群对狂犬疫苗诱导的免疫反应的调控作用。

肠道菌群 clostridia gut microbiome humoral immunity Lachnospiraceae

回肠菌群

人远端回肠菌群与结肠菌群显著不同

一直以来，人们对于健康人回肠远端部分的菌群组成的研究得出不同的结论。早期的研究认为，这里的菌群是稀少的，且近似于口腔菌群，而近期的研究则认为这里的菌群数量大，且更接近于结肠菌群。这可能是由于收集和检测方法不同导致的。早期的研究采用的是在手术过程中获取回肠组织进行菌落培养的技术，而近期的研究则多是穿刺取样，后者不可避免地会接触到其他组织。发表在Clinical Microbiology and Infection上的一项研究，通过手术取样获得150份回肠粘膜样品并通过Maldi-TOF MS检测了微生物种类，发现其微生物种类少、丰度低，与结肠微生物群显著不同。并通过检测它们的生长评估了它们与年龄、抗生素使用、便秘、质子泵抑制剂治疗之间的相关性。该研究强调了取样方法的重要性。

回肠菌群肠道菌群菌种鉴定相关性分析远端回肠菌群

癌症

国内团队：大肠癌和肝癌中肠道菌群如何变化？（综述）

结直肠癌（CRC）和肝细胞癌（HCC）都是常见的癌症死亡原因。肠道菌群组成的病理改变导致的肠道炎症是HCC和CRC的共同因素。受病因和环境因素的影响，癌症患者的肠道微生物群随着疾病的发生以独特的方式发展。来自上海交通大学附属第六人民医院和香港浸会大学的Wei Jia研究团队在Protein & Cell发表最新综述，研究了不同阶段的HCC和CRC肠道菌群组成的变化。

癌症肠道菌群结直肠癌肝细胞癌

衰老

Cell子刊：肠道菌群与老年健康（综述）

“很多人都想长生不老，但却并没有人希望老去。”衰老似乎是人们比较恐惧的一个问题，尤其是衰老带来的一系列健康问题。最近的研究分析结果表明，衰老与肠道菌群也有着千丝万缕的联系。Cell Host and Microbe上发表的最新综述，介绍了衰老过程中的生理和免疫变化如何促成菌群失调，及其对老年健康的潜在影响，总结了长寿老人与老年衰弱者的菌群差异，并展望了或能改善老年健康的菌群干预方法。

衰老 microbiota aging age-associated inflammation intestinal permeability

肠道菌群

益生元减肥？不同个体效果差异大

随着肠道菌群研究的火热，越来越多的产品打出“益生元减肥”的旗号，但是效果“参差不齐”。这些产品真有优良之分？本研究做了很有趣的临床试验。其用粪便中短链脂肪酸作为“健康标志物”，看看不同益生元对其的影响。发现在不同个体中，这种作用的差异巨大。这也提示我们，“一人一方”可能是未来肠道菌群干预研究中需要着重考虑的事情。

肠道菌群研究论文医学研究肥胖儿童益生菌/益生元

维生素D补充

母婴维生素D补充对婴儿肠道菌群或存影响

本研究通过队列研究的样本数据进行分析后发现，母亲在孕期以及新生儿产后补充维生素D可能影响新生儿的肠道菌群结构，而这其中最为重要的混杂因素为是否母乳喂养。同时，作者通过对艰难梭菌含量的鉴定，评估了维生素D补充对未来儿童呼吸系统感染风险的潜在益处。

维生素D补充肠道菌群研究论文孕妇新生儿

O-聚糖酶

Nature子刊：新型GH16家族O-聚糖酶用于肠道黏蛋白降解

肠道黏液层是将肠道组织、免疫系统与肠道菌群、致病菌、内容物分离的重要屏障。肠道菌群的一些成员可利用黏蛋白作为营养来源，但是缺乏对用于分解这些复杂大分子的机制的理解。发表在Nature Communications上的一项研究，通过数据挖掘在四种主要的肠道黏蛋白降解菌（B.thetaiotaomicron，B.fragilis，B.caccae和A.muciniphila）中鉴定了9个GH16家族的O-聚糖酶，对它们的底物谱、作用方式、晶体结构等进行了详细表征，为了解黏蛋白被正常菌群分解的机制提供了重大进展。同时，还表明这些酶具有在肠道疾病状态下探索O-聚糖结构变化的潜在用途。

O-聚糖酶糖苷水解酶底物特异性三维结构 GH16

肠内分泌L细胞

Cell子刊：肠腔信号如何调控肠内分泌L细胞分化？

Cell Reports近期发表的文章，揭示出肠道上皮细胞的O-GlcNAc修饰信号对微生物来源的短链脂肪酸较为敏感，进而控制肠道内分泌细胞的谱系分化和功能，调控系统性能量和血糖代谢。

肠内分泌L细胞 O-GlcNAc L cells GLP-1 Obesity

肠-肝轴

刘宏伟、刘双江等：肠道拟杆菌-叶酸-肝脏轴的活化可减轻NAFLD

非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）是一种常见的代谢疾病，但目前缺少有效的药物疗法。中科院微生物所刘宏伟、刘双江与团队此前合成了一种可有效改善小鼠代谢综合征的灵芝杂萜衍生物（GMD）（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1087350568），在此基础上，他们在Cell Reports发表的最新研究中，以大鼠为模型探究了GMD治疗NAFLD的效果，并揭示了GMD通过富集解木聚糖拟杆菌等特定的肠道拟杆菌属细菌，激活拟杆菌-叶酸-肝脏轴途径，从而调节肝脏脂代谢减轻NAFLD的机制。这些发现为GMD和解木聚糖拟杆菌对NAFLD的潜在治疗作用提供了证据。

肠-肝轴非酒精性脂肪性肝病 nonalcoholic hepatic steatosis a Ganoderma meroterpene derivative a gut Bacteroides-folate-liver axis

肠道菌群

桂林医学院：肥胖者的肠道菌群和代谢物的变化

桂林医学院陈健和Keng Po Lai与团队的研究成果。研究通过对肥胖和正常成年人的粪便进行组学整合分析和对比，发现肠道菌群及其代谢物在肥胖的发生和发展中起着重要作用，尤其是肠道菌群代谢物与宿主体内代谢物呈现共变化趋势。同时，显著差异代谢物或可作为肥胖诊断和治疗的靶点。

肠道菌群肥胖 Obesity Metabolite Gut microbiota

牛肉

吃牛肉对肠道菌群有何影响？（综述）

牛肉是人们常吃的红肉之一，近年的营养流行病学研究表明，吃过多红肉可能增加心血管疾病和糖尿病等疾病风险，但牛肉对肠道菌群的影响尚不十分清楚。Advances in Nutrition近期发表的系统综述，汇总分析了相关的动物和人体研究的发现，并对目前仍存在的知识缺口进行了探讨。

牛肉 beef beef protein health microbiota

精油

精油、饮食和菌群互作或影响体重控制（综述）

发表在Trends in Food Science and Technology上的文章。由于精油的化学属性，其具有潜在的抑制病原菌作用。文章通过分析现有的研究结果发现，精油或可结合膳食，对肠道菌群进行干预，进而控制体重。但是精油的使用需要考虑其安全剂量。

精油体重控制肠道菌群 microbiota essential oil

神经性厌食症

厌食症患者的肠道菌群有多紊乱？

肠道菌群产生大量生物活性物质，可影响宿主脑部功能和行为，可能与神经性厌食症（AN）相关。Clinical Nutrition近期发表的一项临床研究发现，厌食症患者在发病期间（体重过轻）有严重的肠道菌群紊乱，特别体现在菌群-代谢物相关关系变化上。

神经性厌食症 Anorexia nervosa gut microbiome Fecal metabolome eating disorders

表观遗传

Nature：特定菌群产物可活化HDAC3，促进肠道损伤修复

共生菌群对宿主的影响体现在很多方面，包括通过表观遗传来调控宿主细胞功能。Nature最新发表了来自美国辛辛那提儿童医院医学中心的研究，发现肠道菌群代谢膳食植酸产生的三磷酸肌醇等代谢物，可拮抗丁酸对肠道组蛋白脱乙酰酶3（HDAC3）的抑制作用，诱导HDAC3的活化，从而促进肠上皮细胞增殖和肠道损伤修复，或能用于改善炎症性肠病。HDAC3作为重要的表观遗传调控因子，可接收多种菌群和饮食信号，连接宿主生理和环境。

表观遗传菌群代谢产物肠道菌群膳食植酸三磷酸肌醇

孕期饮食与后代健康

母亲孕期饮食结构影响母婴肠道菌群

孕期女性饮食摄入，尤其是饱和/单不饱和脂肪酸的摄入量与其自身，以及婴儿的肠道菌群结构存在关联。而婴儿肠道菌群与长期的健康风险均存在关联，所以可考虑通过孕妇饮食干预，促进婴儿的健康成长。

孕期饮食与后代健康研究论文医学研究孕妇新生儿

肠道菌群

坚果对人体肠道菌群的影响（综述）

坚果是一种富含纤维和多酚的食物，这些食物成分已被证明对肠道菌群有益。近期发表于《British Journal of Nutrition》的一项系统综述通过调研、筛选、总结已发表的相关文献，旨在综合有关坚果摄入对人体肠道菌群影响的证据。这篇综述表明坚果摄入有可能对肠道菌群产生一定的影响，尽管确切的影响在各个研究中并不一致。更多的研究需要考虑试验设计、个体间菌群差异、分析方法、饮食习惯等因素，以获得可靠结论。

肠道菌群坚果 Nuts gut microbiome Gut microbiota

抗生素

生命早期单疗程抗生素治疗，或可增加之后的结肠炎风险

幼年期的肠道菌群可能对长期健康产生深远影响。Martin Blaser团队近期在Genome Medicine发表一项小鼠研究，发现在生命早期进行单个疗程的泰乐菌素（而非阿莫西林）抗生素处理，可通过对肠道菌群组成和粘膜免疫的影响，增加小鼠断奶后对DSS诱导的结肠炎的易感性。

抗生素生命早期 Childhood antibiotic use DSS-induced colitis gastrointestinal microbiota