Susanne Brix

肠道免疫肠道细菌 IgA缺乏症

克罗恩病（CD）是炎症性肠病中一大类疾病，由于其发病机制复杂，目前尚没有有效的治愈方法，在临床上主要通过监测肠粘膜的动态从而针对性抑制疾病的发作期。从免疫病理学机制来看，CD通常认为是I型和17/3型免疫反应不受控制，尽管已经对引起免疫的细胞因子有了较为清晰的认识，但是对于免疫反应效应因子免疫球蛋白在CD中的作用和特异性目前尚没有相关深入的报道。近期一篇发表在Gut上的研究论文，通过对荷兰30个正常人群队列和60例CD患者，包括发作期和静息期患者中被免疫球蛋白包被菌群的类型进行了详细的研究和分类，发现重度CD患者以及CD活动期与IgG2包被细菌显著相关。同时发现伴随IgG2包被细菌存在的还有两种未包被的病原菌，提示这些逃逸包被的病原菌是CD发作的重要原因。

免疫球蛋白包被 IgG2 弯曲杆菌曼海姆菌克罗恩病

双向情感障碍

胡少华+宋学勤+聂超等：双相情感障碍中“菌群-肠-脑轴”新机制

双相情感障碍（也称躁郁症；BD）是一种常见的、高自残的精神疾病，伴有睡眠、思维和行为改变。BD为间断性病程，有躁狂发作、轻躁狂发作及抑郁发作方式，因病因复杂，BD的临床诊治面临极大挑战。近年来，多项研究发现脑-肠-微生物轴和BD等精神疾病密切相关，但确切的参与机制不明。近日，浙大一院胡少华、华大基因聂超、郑大一院宋学勤、联合丹麦的团队在Molecular Psychiatry发表研究，发现BD患者肠道菌群失调，血清代谢物水平发生明显变化，Akk菌和柔嫩梭菌等与B族维生素、短链脂肪酸衍生物、犬尿氨酸及GABA等神经活性代谢物显著相关。血清非靶向代谢组学、粪便宏基因组学以及脑部磁共振联合分析，发现BD患者血清代谢物对大脑功能活动的影响大于肠道菌群。总之，该研究为构建以肠道菌群为靶点，实现临床BD的精准诊疗提供了新的线索。

双向情感障碍多组学分析研究论文医学研究临床对照实验

双歧杆菌

Nature子刊：母乳相关双歧杆菌产生的芳香族乳酸或可影响新生儿免疫

母乳喂养对塑造婴儿的肠道微生物群具有重要作用，进而影响生命早期免疫发育。肠道微生物群可以各种方式影响宿主的生理，比如通过微生物代谢物。然而，目前关于母乳依赖的微生物代谢物介导宿主和微生物的相互作用知之甚少。Nature Microbiology近期发表的文章，证明了能利用母乳寡糖的双歧杆菌物种，通过一种以前未被识别的芳香乳酸脱氢酶（ALDH），在婴儿肠道中产生大量的芳香族乳酸，包括吲哚乳酸（ILA）等，粪便中这种代谢物的浓度与婴儿粪便激活AhR的能力相关。进一步研究证明，ILA通过AhR和羟基羧酸受体3依赖途径影响体外免疫功能，提示母乳相关的双歧杆菌通过生产芳香乳酸影响早期生命免疫系统。

双歧杆菌芳香族乳酸

阴道菌群

阴道菌群失调或增加剖宫产风险

本研究通过纵向阴道菌群的评估，揭示了女性孕期阴道菌群结构的变化规律，具有重要的临床意义。同时，本研究还创造了一套阴道微生态失调评分系统，该评分与紧急剖宫产风险之间存在关联，具有较大的临床推广价值。

阴道菌群研究论文剖宫产率细菌性阴道炎

肠道菌群

孕期母体肠道菌群或影响子代过敏风险（综述）

本综述总结了现阶段有关妊娠期母亲菌群与子代哮喘和过敏风险之间关联的证据，并提出了新的假说，为进一步开展相关研究提供了思路。

肠道菌群综述哮喘过敏

菌群-免疫互作

IgA缺陷者的肠道菌群失调

IgA缺陷可能导致复发性粘膜感染，可能与肠道菌群的变化相关。来自Gastroenterology上发表的一项最新研究，发现相比于IgA水平正常者，IgA缺陷者的肠道菌群多样性、组成及功能均显著改变，IgA缺陷者的肠道菌群有着更高的致病性及促炎性。另外，在部分IgA缺陷者的血清中可检测到IgA特异性IgG抗体，而这部分个体的肠道菌群失调更为明显。

菌群-免疫互作研究论文基础研究队列研究 IgA

遗传-菌群互作

张涛+贾慧珏+侯勇：深度剖析中国人的遗传-菌群关联

人体遗传因素在一定程度上能影响肠道菌群的组成和功能，但相关研究尚未充分开展。Cell Discovery近期发表了深圳华大生命科学研究院张涛、贾慧珏、侯勇与研究团队的成果，纳入近1300名中国人，首次通过深度的全基因组和宏基因组测序，分析了宿主遗传（常见变异、罕见变异和拷贝数变异）与肠道菌群之间的关联，并首次揭示了这些关联中的性别差异。这些发现对于研究宿主遗传因素对肠道菌群的影响及其在健康与疾病中的作用，有重要参考意义。

遗传-菌群互作微生物组全基因组关联分析性别差异

减肥干预

华大研究院：谁更易减肥成功？肠道菌群或是最强预测力

很多人都知道减肥的名言“管住嘴，迈开腿”，但是现实却很残酷，同样的减重措施却有千差万别的结果。近期深圳华大生命科学研究院的蔡锴晔团队与合作者，在Gastroenterology发表的一项相关研究发现，基线时的肠道菌群可以预测节食减肥的结果，且在减重过程中一些细菌种类的丰度发生明显变化。这些发现为基于肠道菌群的个体化减肥饮食干预，提供了新思路。

减肥干预肠道菌群个体化干预热量限制

菌群-免疫互作

城市化相关菌群变化可能增加婴儿的特应性疾病风险

菌群-免疫互作特应性疾病研究论文基础研究婴儿

哮喘

Science子刊：剖腹产相关菌群变化可能增加儿童哮喘风险

Science Translational Medicine上发表的一项前瞻性出生队列研究，对700名新生儿出生后1年内的肠道菌群变化进行分析，并在随访6年期间关注哮喘的发病。对于剖腹产婴儿，出生后1周及1个月的粪便菌群组成显著不同于顺产婴儿，而在出生后1年时这种差异变得很小。而对于部分在1岁时仍有着与顺产儿显著不同的菌群组成的剖腹产儿，其哮喘风险较高。这些发现提示，帮助剖腹产婴儿在1岁时恢复正常的肠道菌群发育和成熟，或有助于减少之后的哮喘风险。

哮喘研究论文基础研究出生方式出生队列研究

精神分裂症

马现仓+贾慧珏等：精神分裂症患者的肠道微生物组特征

肠道菌群可作用于肠脑轴，与神经疾病的发生存在密切关联。Nature Communications最新发表了来自西安交大一附医院马现仓团队和华大基因贾慧珏团队等的合作研究，鉴定出精神分裂症相关的人肠道微生物组的组成和功能特征，为进一步研究其发病机制和治疗方法提供了新线索。有兴趣的读者不妨结合阅读一下他们团队去年发表的一篇相关论文（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1099252167），会有更多收获。

精神分裂症 Risk factors schizophrenia 宏基因组关联分析肠道微生物组

膳食补充剂

Nature子刊：孕期服用膳食补充剂，对婴儿呼吸道菌群有什么影响？

研究表明，孕妇补充鱼油和维生素D可以减少后代哮喘和喘息的发病率，这可能是通过改变孕妇或婴儿的微生物组成实现的。Nature communication最近的研究，给736名孕妇补充n-3长链多不饱和脂肪酸和/或维生素D，或安慰剂，并对695对母婴的菌群（母亲妊娠期阴道菌群、婴儿粪便和呼吸道菌群）进行了分析。结果表明，膳食补充剂能影响婴儿呼吸道菌群组成和呼吸道免疫（如影响鼻内CCL4、TNF-α和CXCL8等细胞因子和趋化因子浓度）。这些膳食补充剂也影响婴儿气道菌群的成熟和特定细菌属的相对丰度。本研究结果提示，孕期膳食补充剂或可调节婴儿呼吸道菌群。

膳食补充剂维生素D N-3长链多不饱和脂肪酸婴儿呼吸道菌群 Marialaura Bonaccio

呼吸道菌群

Nature子刊：早期的呼吸道菌群或能预测儿童哮喘风险

哮喘可能源于生命早期的免疫发育异常，与这一时期的环境因素对呼吸道菌群的影响有关。Nature Communications近期发表一项来自丹麦的前瞻性队列研究，分析了700名儿童生命早期的呼吸道菌群组成，鉴定出特征菌属并构建模型，可预测6岁时的哮喘风险，并揭示了菌群特征与呼吸道免疫之间的关系，为生命早期的菌群-免疫互作对哮喘风险的影响提供了进一步的证据。

呼吸道菌群儿童哮喘菌群-免疫互作前瞻性队列研究婴儿菌群

2型糖尿病

国内团队：前驱糖尿病与未治疗2型糖尿病患者的肠道菌群变化

来自深圳华大基因研究院团队与苏州疾控中心团队合作在EBioMedicine上发表的一项最新研究，通过对未经治疗的2型糖尿病患者、前驱糖尿病患者及血糖正常的健康人的肠道宏基因组及宏蛋白组进行分析对比，鉴定出了2组患者在肠道菌群及功能上的变化。

2型糖尿病 metagenomics Metaproteomics prediabetes Treatment-naïve type 2 diabetes

菌群-肠-脑轴

马现仓+贾慧珏等：肠道菌群异常可影响色氨酸代谢，促进小鼠精神分裂症状

Molecular Psychiatry最新发表了由西安交通大学附属第一医院马现仓和华大基因贾慧珏等主导的研究，用粪菌移植等方法表明肠道菌群异常可促进精神分裂症，一定程度上与菌群引起的色氨酸代谢异常（色氨酸-犬尿氨酸-犬尿喹啉酸通路上调）有关，提示菌群-肠-脑轴在精神分裂症中的重要作用。

菌群-肠-脑轴精神分裂症粪菌移植小鼠色氨酸代谢

儿童肠道菌群

学龄儿童可能存在3种肠型特征

儿童肠道菌群 School-age children Gut microbiota enterotype Metabolic phenotypes

低谷蛋白饮食

Nature子刊：低麸质饮食怎样影响健康人的肠道菌群和代谢？

越来越多的人开始尝试低谷蛋白饮食，但其对健康人的影响尚未明确。Nature Communications上发表的一项最新研究，在60名健康中年人进行了一项随机对照交叉试验，发现低谷蛋白/麸质饮食可改变肠道菌群，减少氢气呼出量并改善腹胀，降低体重并减少炎症小体激活。

低谷蛋白饮食 Shahrad Taheri Hadeel Zaghloul Odette Chagoury

子宫共生菌群

华大基因+北大深圳医院：宏基因组测序表明子宫有菌

这是华大基因贾慧珏博士领衔并与北大深圳医院吴瑞芳教授合作的女性生殖道菌群研究的新进展。在之前研究（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1058590604）的基础上，他们又结合Illumina和BGISEQ-500测序平台，通过宏基因组测序鉴定了从阴道至腹膜液微生物的渐变特征，还通过附加人群交叉验证了所得结论。迄今为止最为系统的中国人女性生殖道菌群研究，值得特别关注。相关阅读：Microbiome：现有证据不足以支持子宫内有菌（综述）（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1033194888）；子宫内膜有什么菌群？对生育有何影响？(综述)（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1091906476）；Nature：子宫里的胎儿有菌无菌？可能有但争议犹存（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1067265924）；Lancet子刊：菌群研究要警惕“喜马拉雅山上的蓝鲸”（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1090644533）。

子宫共生菌群 metagenomics microbiota Female upper reproductive tract 宏基因组测序

全谷物

Gut：全谷物可减重并缓解炎症，但不明显影响菌群

这是刚刚发表的一项随机交叉试验，对比了全谷物饮食和精细谷物饮食对有代谢综合征风险的参与者的影响，一定程度验证和说明了全谷物对身体的益处，值得关注的是，肠道菌群及其代谢产物、胰岛素敏感度等未发现明显变化。值得关注，特别推荐。

全谷物减肥炎症 COLONIC MICROFLORA Diet

血清代谢组学

Nature：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险

血清代谢组学胰岛素抵抗支链氨基酸转运蛋白葡萄糖不耐受