菌菌君

白色念珠菌对于维持肠道细菌菌群以及肠道稳态至关重要，与其相关的菌群失调可引起乳酸菌的水平显著改变。Clinical Microbiology Reviews发表的这篇综述中，介绍了白色念珠菌、乳酸杆菌以及粪肠球菌这三种微生物的背景知识，并讨论了它们相互调节其生长和毒力的机制。这三种微生物在胃肠道中的相互作用，可为现有抗菌疗法功效的提高提供新的见解。

肠道真菌白色念珠菌乳酸菌肠球菌乳杆菌

异基因造血干细胞移植

儿童异基因造血干细胞移植治疗的菌群分析

接受异基因造血干细胞移植（HSCT）的患者表现出肠道微生物群的变化，并可能经历一系列并发症，包括急性移植物抗宿主病（aGvHD）。Microbiome近期发表文章，通过对29例HSCT治疗的儿童患者进行肠道、口腔和鼻腔菌群的动态监测，绘制了移植后三个部位的菌群变化图谱。同时发现移植前三个部位的菌群构成可用于预测移植后aGvHD的发生，且免疫稳态的重建与三个部位的菌群具有相关性。

异基因造血干细胞移植儿童菌群急性移植物抗宿主病

粪菌移植

FMT能否影响促癌大肠杆菌的存留和清除？

Gastroenterology近期发表一项小型的回顾性研究，粪菌移植（FMT）可影响复发性艰难梭军感染（rCDI）患者肠道菌群中的pks+大肠杆菌的存留或清除，但不太可能出现供体向患者传播pks+大肠杆菌的情况。

粪菌移植 pks+大肠杆菌复发性艰难梭菌感染结直肠癌

光照治疗

多晒太阳可能预防食物过敏？

缺乏日晒可能导致维生素D3的缺乏，而维生素D3不足是食物过敏的风险因素之一。NPJ Biofilms and Microbiomes上发表的一项最新研究，在OVA诱导的食物过敏小鼠模型中发现，全光谱光照可缓解过敏性腹泻，抑制肥大细胞活化，降低肠道炎症应答，同时可改善维生素D3的缺乏，并恢复肠道菌群组成。另外，粪菌移植实验证实了肠道菌群失调可介导食物过敏。该研究结果提示，光照疗法可通过调节维生素D3状态及肠道菌群组成以预防食物过敏。

光照治疗研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）食物过敏

粪菌移植

粪菌移植治疗活动性外周银屑病关节炎可能无效

Annals of the Rheumatic Diseases上发表的一项随机对照试验结果，在31名活动性外周银屑病关节炎（PsA）中，分别进行粪菌移植或假手术干预，粪菌移植的安全性良好，但治疗失败率比假手术更高，且在HAQ-DI评分、ACR20等次要指标上也劣于或不优于假手术。

粪菌移植银屑病关节炎研究论文医学研究随机对照试验

母婴菌群传递

陈卫院士团队：聚焦母婴肠道双歧杆菌类群

江南大学陈卫团队与爱尔兰Teagasc 食品研究中心Catherine Stanton合作，在Gut Microbes发表文章，阐述母婴间肠道菌群的关系，特别是双歧杆菌类群，值得关注。

母婴菌群传递双歧杆菌研究论文基础研究

菌群-免疫互作

克罗恩病患者对细菌鞭毛蛋白的抗体应答增强

Gastroenterology上发表的一项最新研究，发现在克罗恩病（CD）患者的血清中，对细菌鞭毛蛋白（毛螺菌科鞭毛蛋白）的IgG反应增强，而溃疡性结肠炎（UC）患者中则无此现象。部分患者对多种毛螺菌科鞭毛蛋白产生了抗体反应，并与鞭毛蛋白特异性CD4+ 记忆T细胞的增加及鞭毛蛋白特异性CD4+ Treg的减少相关。该研究结果提示，靶向菌群抗原或是治疗克罗恩病的潜在策略。

菌群-免疫互作研究论文基础研究鞭毛鞭毛蛋白

藏灵菇发酵奶

酵母菌益生新发现：真菌分泌代谢物乙酸色醇

“藏灵菇”不是蘑菇，而是西藏土生土长的，一种有生命的珍稀菌种，属于开菲尔中的一个品系。当地人自古以来就在家中泡牛奶喝。科学家在这种物质中发现了许多微生物，它们经过长期的相互适应和协同作用形成了复杂的菌相。Microbiome上发表文章，对西藏开菲尔/藏灵菇发酵奶进行了深度分析，很有意思。

藏灵菇发酵奶乙酸色醇研究论文

菌群-免疫互作

清华大学：丁酸如何增强化疗抗癌疗效？

来自清华大学的郭晓欢团队在Cell Metabolism上发表的一项最新研究，发现肠道菌群代谢产生的丁酸盐可通过诱导ID2的表达，促进IL-12信号通路，从而直接增强小鼠CD8+ T细胞的抗肿瘤细胞毒性效应，以促进化疗药物奥沙利铂的抗癌疗效。在肿瘤患者中也可发现，对奥沙利铂应答的患者的血清丁酸盐含量显著升高。

菌群-免疫互作研究论文基础研究啮齿动物（小鼠） CD8+ T细胞

食道鳞状细胞癌

深圳大学：消化道肿瘤免疫治疗的新靶点

实体瘤对免疫检查点抑制剂治疗的反应较差，其中一个主要原因是抑制性的肿瘤微环境。而肿瘤相关的成纤维细胞（CAFs）是肿瘤微环境的重要组分，负向调控抗肿瘤的T细胞反应，在食管鳞癌和结直肠癌的恶性进展中有重要作用。深圳大学付利团队在Gut上发表文章，发现CAFs可以通过分泌WNT2抑制抗肿瘤免疫，靶向WNT2或可增加免疫检查点阻断疗法的效果。

食道鳞状细胞癌直结肠癌肿瘤相关成纤维细胞 WNT2 树突状细胞(DC)

AKK菌

Akk菌或可改善脂肪肝炎相关的认知功能障碍

高脂高胆固醇（HFHC）饮食通常用于诱导早期非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型。Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现环境强化（EE）或应用Akk菌CIP107961（AKK）可逆转HFHC饮食诱导的大鼠认知功能障碍，而鼠李糖乳杆菌GG（LGG）无此作用。机制上，AKK通过增强大脑代谢活性，而EE通过降低大脑代谢活性并改变肠道菌群组成而发挥作用。该研究结果提示，AKK或可用于治疗NASH相关的认知功能障碍。

AKK菌认知障碍肠-脑轴研究论文基础研究

Cell子刊：大规模功能遗传学揭示肠道共生多形拟杆菌跨环境生长的代谢需求

由于对肠道细菌大部分基因的功能尚不清楚，导致肠道菌群利用度受到限制。Cell Reports上这篇文章，利用大规模功能遗传学揭示了人类肠道共生多形拟杆菌跨环境生长的代谢需求。

空肠弯曲杆菌

Nature子刊：空肠弯曲杆菌如何入侵细胞

空肠弯曲杆菌是一种食源性病原体，结合并侵袭人体肠道上皮细胞。Nature Communications近期发表的文章，发现鞭毛分泌效应蛋白CiaD靶向宿主蛋白IQGAP1，增加局部Rac1的活性，促进空肠弯曲杆菌对细胞的入侵。同时证明空肠弯曲杆菌入侵细胞是一个病原体驱动的过程，依赖于细胞结合和效应传递（结合和效应机制）。

空肠弯曲杆菌弯曲杆菌入侵抗原 IQGAP1 宿主细胞入侵

抗生素

如何减少抗生素引起的肠道菌群失调？（综述）

抗生素治疗可能引起肠道菌群失调，从而间接地危害人体健康。Drug Discovery Today近期发表的这篇小综述，重点介绍了目前研究的预防和修复抗生素诱导的肠道菌群失调的方法，探讨了这些方法在临床转化方面面临的困难，推荐专业人士参考。

抗生素肠道菌群失调

小檗碱

国内团队：小檗碱或可调节肠脑轴以治疗帕金森病

酪氨酸羟化酶是产生左旋多巴的限速酶。中国医学科学院药物研究所的蒋建东团队、王琰团队及中国医学科学院基础医学研究所的曹雪涛团队在Signal Transduction and Targeted Therapy上发表的一项最新研究，发现在帕金森病（PD）小鼠模型中，口服小檗碱（BBR）可通过增强肠球菌属的酪氨酸羟化酶活性，促进肠道中的左旋多巴产生，从而增加大脑中的多巴胺水平，以改善PD症状，在临床研究中也有相似发现。

小檗碱帕金森病研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）

微生态疗法

Lancet子刊：口服冻干细菌胶囊可有效治疗复发性艰难梭菌感染

微生态疗法2（MET-2）是一种口服冻干细菌胶囊，含有40种分离自健康人粪便的细菌物种。Lancet Gastroenterology & Hepatology上发表的一项1期临床试验结果，在19名复发性艰难梭菌感染（rCDI）患者中，口服MET-2的安全性及耐受性良好，且2次给药可在84%的患者中长期（长达数个月）防止rCDI。

微生态疗法研究论文医学研究 1期临床试验复发性艰难梭菌感染

细菌疗法

Nature子刊：细菌疗法有望治疗特应性皮炎

金黄色葡萄球菌定殖于特应性皮炎（AD）患者的皮肤上，通过促进炎症以恶化疾病。来自Nature Medicine上发表的一项1期临床试验结果，报道了一种分离自健康人皮肤中的细菌——人葡萄球菌A9（ShA9）用于治疗AD的安全性及有效性。在临床前研究中，ShA9可杀死小鼠皮肤表面的金黄色葡萄球菌，并降低后者的psmα毒素表达，从而改善疾病评分。在54名金黄色葡萄球菌阳性的AD患者中，使用ShA9治疗并未导致严重不良事件的发生，并可显著抑制金黄色葡萄球菌的定殖及psmα毒素的表达。同时，对于部分患者（其皮肤上定殖的金黄色葡萄球菌对ShA9敏感），ShA9可显著改善湿疹。

细菌疗法医学研究研究论文 1期临床试验特应性皮炎

新冠肺炎

张驰宇+张志刚等：新冠患者上呼吸道和肠道菌群之间的动态关联

新冠病毒可感染的细胞分布于呼吸道和消化道，这两个部位也是共生微生物-宿主互作的热点区域。Communications Biology近期发表上海公共卫生临床中心张驰宇、金侠和云南大学张志刚与研究团队的成果，发现新冠患者的咽部和肠道菌群多样性降低，随着病程发展，两处的共生菌群多样性同步增加。本研究发现的特征菌群和代谢产物，有望用于指示病程发展并指导治疗，也为开发基于菌群干预的新疗法提供了一定的参考。

新冠肺炎口腔菌群肠道菌群

肺结核

浙大一院：肺结核患者的肠道菌群特征和代谢变化

肠道菌群在肺结核（PTB）的发生发展中起着重要作用。浙江大学附属第一医院的李兰娟院士和徐凯进与研究团队在Microbial Biotechnology上发表文章，发现了PTB患者的肠道菌群处于失衡状态和粪便代谢组图谱的变化，提示肠道菌群和粪便代谢组或可作为预防和治疗PTB的潜在靶点。

肺结核肠道菌群粪便代谢组

白色念珠菌

王婷婷等：白色念球菌加重结肠癌进展

结肠癌的发生与肠道菌群也有着密切的关系。目前已经明确一些肠道细菌与结肠癌的发生有直接的关系。然而肠道菌群的构成不仅仅有细菌，还有真菌，病毒等，肠道真菌与结肠癌发生的关系并不明确。国内南京大学王婷婷团队在EMBO Journal近期发表的研究工作详细探索了肠道真菌与结肠癌之间的关系。他们通过小鼠突变体，粪菌移植，真菌定植等方法发现，白色念珠菌可以显著促进结肠肿瘤的发生，其具体的机制是白色念珠菌会介导巨噬细胞糖酵解途径上调，从而上调IL7的表达和分泌。IL7通过AhR和STAT3 途径诱导3型固有淋巴细胞（ILC3）表达高水平的IL22，从而促进结肠癌进程。这一研究结果揭示了真菌与结肠癌进展的关系，为结肠癌临床干预提供了新的思路。

白色念珠菌巨噬细胞 3型天然淋巴细胞 IL-22 结肠癌

咖啡

机器学习结果：咖啡摄入与心力衰竭风险相关

基于弗雷明汉心脏研究（FHS）、心血管心脏研究（CHS）以及社区动脉硬化风险（ ARIC）三项研究，利用机器学习探究与心脏病、中风、心力衰竭等相关的生活方式或行为习惯特征。研究结果显示，咖啡、红肉、牛奶等饮食习惯、婚姻状态等影响心脏相关疾病风险。尤其，三项研究均显示，咖啡的高摄入与心力衰竭降低有关。但是给出相关推荐前，仍需要进一步探究其背后的相关机制。

咖啡心力衰竭机器学习

慢性结肠炎

浙江大学团队：青春双歧杆菌如何缓解慢性结肠炎？

炎症性肠病(IBD)是一种预后不良的免疫失调疾病。来自浙江大学Shujie Chen、Jianmin Si及Tongyao Hou团队发表在Gut Microbes的研究，旨在探讨B. adolescent对IBD的治疗作用，以及B. adolescent对IBD的免疫和微生态机制。结果表明，B. adolescent通过诱导保护性的Th2/Treg反应和重塑肠道微生物群，来缓解DSS诱导的慢性结肠炎。本研究结果提示，B. adolescent或可提高炎症性肠病的临床治疗效果。

慢性结肠炎青春双歧杆菌肠屏障肠道微生物免疫调节

癌症治疗

Cell子刊：国内团队发现蒙脱石或可调控肠道菌群辅助癌症免疫治疗

利用益生菌调节免疫系统是一种潜在抗肿瘤策略，但由于外源性细菌在宿主肠道的定植能力弱，所以口服无效。南京大学张俊峰、董磊和澳门大学的王春明合作在Cell Reports上发表文章，发现蒙脱石有助于益生菌在其表面形成生物膜，促进益生菌在肠道定植，增强化疗或免疫治疗的效果，或是一种有前景的辅助癌症免疫治疗的策略。

癌症治疗益生菌定植蒙脱石生物膜biofilm

粪菌移植

艰难梭菌感染患者粪菌移植后，菌群的长期变化如何？

来自mSystems上发表的一项纵向队列研究结果，对37名接受口服冻干粪菌移植（FMT）治疗的艰难梭菌感染（CDI）患者进行中位17周（最短4周、最长26周）的随访，监测肠道细菌及真菌的变化情况，发现应答患者的肠道菌群多样性显著增加，且菌群组成趋向于供体菌群。

粪菌移植艰难梭菌感染研究论文纵向队列研究冻干粪菌移植胶囊

菌群代谢产物

Nature Reviews：微生物的挥发性有机化合物（综述）

菌群代谢产物挥发性物质微生物生态学

阿尔兹海默症

丽水二院：中国阿尔茨海默症患者的粪便真菌变化

来自丽水市第二人民医院的吴绍长团队在Frontiers in Cell and Developmental Biology上发表的一项病例-对照研究结果，对比了88名中国阿尔兹海默症（AD）患者及65名认知正常对照的粪便真菌，鉴定出了AD患者的粪便真菌组成及功能的变化，以及发生变化的真菌分类群与宿主免疫应答的关联。

阿尔兹海默症研究论文肠道真菌病例-对照研究

益生菌

嗜酸乳杆菌在宿主肠内时，双方的基因表达有何变化

嗜酸乳杆菌NCFM是一株被广泛应用的益生菌。mBio近期发表研究，通过双RNA-seq技术，对NCFM在小鼠肠道内时双方的基因表达变化以及NCFM的基因组稳定性进行了分析，为揭示其益生作用和机制提供了新证据。

益生菌嗜酸乳杆菌NCFM

通佐溴胺

通佐溴胺影响口腔菌群，进而影响肠道菌群

药物与肠道菌群的互作是最近的研究热点，也是亟待解决的科学疑惑。本研究关注通佐溴胺（TB）的使用对口腔以及肠道菌群的影响。研究结果显示，TB的使用降低口腔罗氏菌属和韦荣球菌，但几乎不影响肠道菌群。进一步基于机器学习进行深入分析，发现口腔与肠道菌群之间的相互作用。口腔菌群的改变，则会导致肠道中出现特定的口腔菌。由此看来，一个可能的观点是：药物对菌群的干预具有原位性，而机体全身的肠道菌群存在互通。

通佐溴胺口腔菌群肠道菌群机器学习

益生菌

张和平团队：益生菌增强肠道菌群的神经刺激活性以缓解压力与焦虑

先前的一项随机双盲安慰剂对照试验表明，补充植物乳杆菌P-8可缓解成年人的压力与焦虑。内蒙古农业大学的张和平团队在Neurobiology of Stress上发表的一项最新研究，对该试验的结果进行深入分析后发现，植物乳杆菌P-8可调节肠道菌群多样性及组成，增加肠道菌群中的神经递质合成/消耗相关通路，并富集潜在的神经活性菌群代谢产物。

益生菌压力焦虑研究论文随机双盲对照实验（RCT）

婴儿肠道菌群

出生后，哪些因素在影响婴儿肠道菌群的形成？（综述）

出生后的头几年是肠道菌群建立和发育的关键时期，FEMS Microbiology Reviews近期发表的综述，从生态学的角度，主要从3个方面介绍了影响肠道菌群早期演化的因素，推荐专业人士参考。

婴儿肠道菌群微生物生态学